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此套餐适用于Biocumonds 3.0版;对于稳定的最新版本版本，请参阅生物仪器。

表示生物序列的字符串对象，以及匹配算法

Bioconductor版本:3.0

内存高效字符串容器、字符串匹配算法和其他实用程序，用于快速操作大型生物序列或序列集。

作者:H. Pages, P. Aboyoun, R. Gentleman, S. DebRoy

维护者：H.页面

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browseVignettes(“Biostrings”)

PDF.	r script.	在生物探测器2中定义的基本类的简短演示
PDF.	r script.	生物热带快速概述
PDF.	r script.	处理探测序列信息
PDF.	r script.	多次对齐
PDF.	r script.	成对序列对齐
PDF.		参考手册
文本		新闻

细节

Biocviews.	DataImport.那DataRepresentation那遗传学那基础设施那序列术那测序那软件
版本	2.34.1
在生物导体中以来	BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 11年)
执照	艺术-2.0
依靠	R（> = 2.8.0），方法，生物根系（> = 0.11.3），S4Vectors.(> = 0.2.2),IRanges(> = 1.99.27),xvector.（> = 0.5.8）
进口	图形，方法，统计数据，Util，生物根系那IRanges那xvector.那Zlibbioc.
链接到	S4Vectors.那IRanges那xvector.
建议	bsgenome.（> = 1.13.14），bsgenome.celegans.ucsc.CE2.（> = 1.3.11），bsgenome.dmelanogaster.ucsc.dm3.（> = 1.3.11），bsgenome.hsapiens.ucsc.hg18那drosophila2probe那hgu95av2probe.那hgu133aprobe.那基因组法(> = 1.3.14),hgu95av2cdf.那affy（> = 1.41.3），affydata(> = 1.11.5),运行
SystemRequirements
加强	RMPI.
URL.
取决于我	altcdfenvs.那Basic4cseq.那脑那bsgenome.那ChIPpeakAnno那Chipsim那切尔弗那CRISPRseek那Dasir.那解码那Deepsnv.那fdb.fantom4.promoters.hg19.那Generegionscan.那基因组那GenomicAlignments那哥特那哈巴普那HireadsProcessor.那iPAC那JASPAR2014那烤肉串那methVisual那Minfi.那motifdb.那motifrg.那oligo.那oneChannelGUI那pd.ag.那pd.aragene.1.0.st.那pd.aragene.1.1.st.st.那pd.ath1.121501.那pd.barley1那pd.bovgene.1.0.st那pd.bovgene.1.1.st那Pd.bovine.那pd.bsubtilis那pd.cangene.1.0.st那pd.cangeene.1.1.st.st.那pd.canine那pd.canine.2那pd.celegans那pd.chicken.那pd.chigene.1.0.st那pd.chigene.1.1.st.st.那pd.chogene.2.0.st.那pd.chogene.2.1.st那Pd.Citrus.那PD.COTTON.那pd.cyngene.1.0.st那pd.cyngene.1.1.st那Pd.cygene.1.0.st.那Pd.cygene.1.1.st.st.那pd.cytogenetics.Array.那pd.drogene.1.0.st.st.那pd.drogene.1.1.st.st.那pd.drosgenome1那pd.drosophila.2那pd.e.coli.2那pd.ecoli.那pd.ecoli.asv2那pd.elegene.1.0.st那pd.elegene.1.1.st那pd.equgene.1.0.st.st.那pd.equgene.1.1.st那pd.felgene.1.0.st.那pd.felgene.1.1.st那Pd.fingene.1.0.st.st.那pd.fingene.1.1.st那pd.genomewidesnp.5那pd.genomewidesnp.6.那pd.guigene.1.0.st.那pd.guigene.1.1.st.st.那pd.hc.g110.那pd.hg.focus.那pd.hg.u133.plus.2那pd.hg.u133a.那pd.hg.u133a.2那pd.hg.u133a.tag.那pd.hg.u133b.那pd.hg.u219那pd.hg.u95a.那pd.hg.u95av2.那pd.hg.u95b.那pd.hg.u95c.那pd.hg.u95d.那pd.hg.u95e.那pd.ht.hg.u133.plus.pm.那pd.ht.hg.u133a那pd.ht.mg.430A那pd.hta.2.0.那pd.hu6800那pd.huex.1.0.st.v2那pd.hugene.1.0.st.v1那pd.hugene.1.1.st.v1那pd.hugene.2.0.st.那pd.hugene.2.1.st.st.那pd.maize那pd.mapping250k.nsp.nsp.那pd.mapping250k.sty.那pd.mapping50k.hind240那pd.mapping50k.xba240那pd.margene.1.0.st.st.那pd.margene.1.1.st.st.那Pd.Medgene.1.0.st.那pd.medgene.1.1.st那Pd.Medicago.那pd.mg.u74a那pd.mg.u74av2那pd.mg.u74b那pd.mg.u74bv2那pd.mg.u74c那pd.mg.u74cv2那pd.mirna.1.0那pd.mirna.2.0那pd.mirna.3.0.那pd.mirna.4.0.那pd.moe430a那pd.moe430b.那pd.moex.1.0.st.v1那pd.mogene.1.0.st.v1那pd.mogene.1.1.st.v1那pd.mogene.2.0.st.那pd.mogene.2.1.st那pd.mouse430.2.那pd.mouse430a.2那pd.mu11ksuba.那pd.mu11ksubb.那pd.nugo.hs1a520180.那pd.nugo.mm1a520177那pd.ovigene.1.0.st.st.那pd.ovigene.1.1.st.st.st.那pd.pae.g1a那pd.plasmodium.anopheles那pd.poplar.那pd.porcine那pd.porgene.1.0.st那pd.porgene.1.1.st那pd.rabgene.1.0.st那pd.rabgene.1.1.st那pd.rae230a.那pd.rae230b.那pd.raex.1.0.st.v1那pd.ragene.1.0.st.v1那pd.ragene.1.1.st.v1那pd.ragene.2.0.st.那pd.ragene.2.1.st.st.那pd.rat230.2那pd.rcngene.1.0.st.st.那pd.rcngene.1.1.st那pd.rg.u34a.那pd.rg.u34b.那pd.rg.u34c.那pd.rhegene.1.0.st.st.那pd.rhegene.1.1.st.st.那pd.rhesus那pd.rice.那pd.rjpgene.1.0.st那pd.rjpgene.1.1.st那pd.rn.u34那pd.rusgene.1.0.st.st.那pd.rusgene.1.1.st.st.那pd.s.aureus.那Pd.soybean.那Pd.soygene.1.0.st.st.那pd.soygene.1.1.st.st.那pd.sugar.cane.那pd.tomato那pd.u133.x3p.那pd.vitis.vinifera那pd.wheat那pd.x.laevis.2那pd.x.tropicalis那pd.xenopus.laevis.那pd.yest.2.那pd.yg.s98那pd.zebgene.1.0.st.st.那pd.zebgene.1.1.st那pd.czebrafish.那PWMEnrich那qrqc那r453plus1toolbox.那Redseq.那RGADEM.那角色威力那rRDP那RSAMTOOLS.那RSVSim那sangerseq.那扫描。通用产品那SCSR.那SEQBIAS.那ShortRead那拼接那ssviz那Systempiper.那三层那挥舞车
进口我	倍数那AllelicImbalance那ArrayExpresshts.那BCRANK那击败那bioseqclass.那biovizBase那bsgenome.那魅力那chipseqr.那Chipsim那克那cobindR那COMPETOOLS.那customProDB那daglogo.那easyrnaseq.那Ensemblvep.那FDB.INFINUIUM甲基化.HG18那Fdb.infiniummethylation.hg19.那Fourcseq.那gcrma那Generegionscan.那GenomicAlignments那基因组法那GGBIO.那GGtools那girafe那GMAPR.那Gviz那Gwascat那H5VC那HiTC那htseqgenie.那凯格斯特那mafdb.all.wgs.wgs.phase1.release.v3.20101123那mafdb.all.wgs.wgs.phase1.release.v3.20101123那mafdb.esp6500si.v2.ssa137.dbsnp138那mafdb.esp6500si.v2.ssa137.dbsnp138那冰雹那Medme.那methVisual那甲基皮脂那microRNA.那motifrg.那MotIV那oligoclasses.那OTUbase那Pbase那pd.081229.hg18.promoter.medip.hx1.那pd.2006.07.18.hg18.refseq.promoter那pd.2006.07.18.mm8.refseq.promoter.那pd.2006.10.31.rn34.refseq.promoter.那pd.atdschip.tiling那pd.charm.hg18.example.那pd.feinberg.hg18.me.hx1.那pd.feinberg.mm8.me.hx1.那pd.hg18.60mer.expr那pd.mirna.3.1.那pdinfobuilder.那phyloseq那聚酯纤维那proBAMr那PVIZ.那qrqc那Quasr.那RCPI.那Redseq.那repitools.那RGADEM.那Rolexa那rqc.那rSFFreader那rtracklayer那SEQARRAY.那seqplots那SGSEQ.那Somaticsignatures.那synapter那TFBStools.那VariantAnnotation.那VariantFiltering那VariantTools那波兰人
建议我	注释那beadarrayusecases.那CSAR.那exoMecopy.那GenomicRanges那genoset那methylumi那microRNA.那幻影那PCAGOPRomoter.那procoil那RPX.那rTRM那SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20090506那SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20100427那SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20101109那snplocs.hsapiens.dbsnp.20110815那SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20111119那snplocs.hsapiens.dbsnp.20120608那SNPlocs.Hsapiens.dbSNP141.GRCh38那xvector.
构建报告

包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

包的来源	BioStrings_2.34.1.tar.gz.
Windows二进制文件	BioStrings_2.34.1.zip.（32-＆64位）
Mac OS x 10.6（雪豹）	BioStrings_2.34.1.tgz.
Mac OS x 10.9（mavericks）	BioStrings_2.34.1.tgz.
Subversion源	（用户名/密码：ReadOnly）
git源	https://github.com/biocumon-mirror/biostrings/tree/release-3.0
包短Url	http://biocidodder.org/packages/biostrings/
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