要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“BiocParallel”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor 3.0版本;有关稳定的最新发布版本,请参见BiocParallel.
Bioconductor版本:3.0
此包提供了用于并行计算的修改版本和新颖函数实现,为与Bioconductor对象一起使用而定制。
作者:Bioconductor Package Maintainer [cre], Martin Morgan [aut], Michel Lang [aut], Ryan Thompson [aut]
维护者:Bioconductor Package维护者< Maintainer at Bioconductor .org>
引文(从R内,输入引用(“BiocParallel”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“BiocParallel”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“BiocParallel”)
BiocParallel简介 | ||
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 基础设施,软件 |
版本 | 1.0.3 |
在Bioconductor | BioC 2.13 (R-3.0)(2.5年) |
许可证 | Gpl-2 | gpl-3 |
取决于 | 方法 |
进口 | 平行,foreach、工具、BatchJobs,BBmisc,BiocGenerics |
链接 | |
建议 | doParallel,雪,Rmpi,GenomicRanges,RNAseqData.HNRNPC.bam.chr14,Rsamtools,GenomicAlignments,ShortRead,RUnit,BiocStyle,knitr |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | ClassifyR,DEXSeq,GenomicFiles,hiReadsProcessor,工商管理硕士,MSnbase,pRoloc,Rqc,SGSeq,ShortRead,SigCheck |
进口我 | ChIPQC,derfinder,DESeq2,flowcatchR,GenomicAlignments,gmapR,h5vc,HTSeqGenie,MethylAid,qpgraph,synapter,TFBSTools,VariantFiltering,VariantTools |
建议我 | ALDEx2,嵌合体,DEGreport,specL,systemPipeR |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | BiocParallel_1.0.3.tar.gz |
Windows二进制 | BiocParallel_1.0.3.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | BiocParallel_1.0.3.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | BiocParallel_1.0.3.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/BiocParallel/tree/release-3.0 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/BiocParallel/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |