要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ arraytools”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。
该软件包适用于生物导体的3.0版;对于稳定的最新版本,请参阅Arraytools。
生物导体版本:3.0
该软件包旨在为质量评估提供解决方案,并检测Affymetrix Genechips的差异表达基因,包括3'阵列和基因1.0 -ST阵列。该软件包以HTML格式生成综合分析报告。报告页面上的超链接将导致一系列QC图,处理的数据和差异表达的基因列表。差异表达的基因以表格格式报告,注释超链接到在线生物数据库。
作者:Xiwei Wu,Arthur Li
维护者:coh.org>的Arthur li
引用(从r内,输入引用(“ Arraytools”)
):
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##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ arraytools”)
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ arraytools”)
R脚本 | 1.底漆 | |
参考手册 |
生物浏览 | 注解,,,,差异性,,,,微阵列,,,,Onechannel,,,,预处理,,,,QualityControl,,,,报告写作,,,,软件,,,,统计信息,,,,可视化 |
版本 | 1.26.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.3(R-2.8)(7。5年) |
执照 | LGPL(> = 2.0) |
要看 | r(> = 2.7.0),副词(> = 1.23.4),生物酶(> = 2.5.5),方法 |
进口 | 副词,,,,生物酶,图形,grdevices,林玛,方法,统计,utils,Xtable |
链接 | |
建议 | 简单,,,,R2HTML,,,,Affydata,,,,affyplm,,,,GeneFilter,,,,安菲,,,,GCRMA,,,,hugene10sttranscriptcluster.db |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
包源 | arraytools_1.26.0.tar.gz |
Windows二进制 | arraytools_1.26.0.zip |
Mac OS X 10.6(雪豹) | arraytools_1.26.0.tgz |
Mac OS X 10.9(Mavericks) | arraytools_1.26.0.tgz |
颠覆源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/arraytools/tree/release-3.0 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/arraytools/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |