要安装这个软件包,请从R开始,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“AnnotationHub”)

在大多数情况下,根本不需要下载包存档。

AnnotationHub

此包适用于Bioconductor的3.0版本;有关稳定的、最新的发布版本,请参见AnnotationHub

用于从AnnotationHub检索Bioconductor对象的客户机

Bioconductor版本:3.0

用于从Bioconductor AnnotationHub在线服务检索数据的客户机。

作者:Marc Carlson, Sonali Arora

维护者:Marc Carlson

引文(从R中输入引用(“AnnotationHub”)):

安装

要安装这个软件包,请从R开始,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“AnnotationHub”)

文档

要查看系统中安装的软件包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“AnnotationHub”)

PDF R脚本 AnnotationHub:用于从AnnotationHub web服务检索数据的客户端包
PDF R脚本 如何为AnnotationHub的新资源编写菜谱
PDF 参考手册
文本 新闻
视频 使用AnnotationDb对象

细节

biocViews 注释,基础设施,软件
版本 1.6.0
Bioconductor自 BioC 2.12 (R-3.0)(3年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 S4Vectors(> = 0.2.3),IRanges(> = 1.99.28)
进口 方法、统计跑龙套,rjson,BiocGenerics,httr,BiocInstaller(> = 1.11.0),AnnotationDbi,GenomicRanges,interactiveDisplay(> = 1.0.23)
链接
建议 RUnit,RCurl,Rsamtools
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我 RefNet
进口我
建议我 GenomicRanges
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源 AnnotationHub_1.6.0.tar.gz
Windows二进制 AnnotationHub_1.6.0.zip
Mac OS X 10.6(雪豹) AnnotationHub_1.6.0.tgz
Mac OS X 10.9 (Mavericks) AnnotationHub_1.6.0.tgz
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/AnnotationHub/tree/release-3.0
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/AnnotationHub/
包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请阅读发布指南。将有关Bioconductor的问题张贴到以下地点之一:

  • 支持网站-关于生物导体封装的问题
  • 正常词 邮件列表-为包开发人员bob电竞体育官网
弗雷德·哈金森癌症研究中心