要安装这个软件包,请从R开始,然后输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“AnnotationHub”)
在大多数情况下,根本不需要下载包存档。
此包适用于Bioconductor的3.0版本;有关稳定的、最新的发布版本,请参见AnnotationHub。
Bioconductor版本:3.0
用于从Bioconductor AnnotationHub在线服务检索数据的客户机。
作者:Marc Carlson, Sonali Arora
维护者:Marc Carlson
引文(从R中输入引用(“AnnotationHub”)
):
要安装这个软件包,请从R开始,然后输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“AnnotationHub”)
要查看系统中安装的软件包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“AnnotationHub”)
R脚本 | AnnotationHub:用于从AnnotationHub web服务检索数据的客户端包 | |
R脚本 | 如何为AnnotationHub的新资源编写菜谱 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
视频 | 使用AnnotationDb对象 |
biocViews | 注释,基础设施,软件 |
版本 | 1.6.0 |
Bioconductor自 | BioC 2.12 (R-3.0)(3年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | S4Vectors(> = 0.2.3),IRanges(> = 1.99.28) |
进口 | 方法、统计跑龙套,rjson,BiocGenerics,httr,BiocInstaller(> = 1.11.0),AnnotationDbi,GenomicRanges,interactiveDisplay(> = 1.0.23) |
链接 | |
建议 | RUnit,RCurl,Rsamtools |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | RefNet |
进口我 | |
建议我 | GenomicRanges |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
包的来源 | AnnotationHub_1.6.0.tar.gz |
Windows二进制 | AnnotationHub_1.6.0.zip |
Mac OS X 10.6(雪豹) | AnnotationHub_1.6.0.tgz |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | AnnotationHub_1.6.0.tgz |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/AnnotationHub/tree/release-3.0 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/AnnotationHub/ |
包下载报告 | 下载数据 |