要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持source(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ tilingarray”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

蒂格拉里

该包适用于生物导体的2.9版;对于稳定的最新版本,请参阅蒂格拉里

带有高密度寡核苷酸瓷砖阵列的成绩单映射

生物导体版本:2.9

该软件包提供的功能可用于分析高密度平铺微阵列数据(例如来自Affymetrix Genechips)的功能,以测量转录本丰度和体系结构。软件包的主要功能是:1。代表线性数据的分区的类“分割”类“分割”;2.使用既快速又精确的动态编程算法拟合分段常数模型的函数“段”;3.使用StrucChange软件包计算置信区间的函数'contint';4.用于生成漂亮图的功能“ plotalongchrom”;5.从一组参考杂交的探针序列响应调整的函数'归一化差异。

作者:Wolfgang Huber,Zhenyu Xu,Joern Toedling,Matt Ritchie的贡献

维护者:zhenyu xu

引用(从r内,输入引用(“ tilingarray”)):

安装

要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持source(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ tilingarray”)

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Tillingarray”)

PDF Ressionnorm.pdf
PDF costmatrix.pdf
PDF findsegments.pdf
PDF plotalongchrom.pdf
PDF 分段.pdf
PDF 参考手册

细节

生物浏览 微阵列,,,,Onechannel,,,,预处理,,,,软件,,,,可视化
版本 1.32.0
在生物导体中 Bioc 1.6(R-2.1)或更早(> 11年)
执照 艺术2.0
要看 r(> = 2.11.0),生物酶, 方法,pixmap
进口 Strucchange,,,,副词,,,,VSN,,,,GeneFilter,,,,rcolorbrewer, 网格
链接
建议
系统要求
增强
URL
取决于我 adacgh2,,,,David Tiling
进口我 Snapcgh
建议我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 tilingarray_1.32.0.tar.gz
Windows二进制 tilingarray_1.32.0.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.6(雪豹)
Mac OS X 10.9(Mavericks)
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/tilingarray/tree/release-2.9
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/tilingarray/
软件包下载报告 下载统计

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