要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url不支持source(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ tilingarray”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。
该包适用于生物导体的2.9版;对于稳定的最新版本,请参阅蒂格拉里。
生物导体版本:2.9
该软件包提供的功能可用于分析高密度平铺微阵列数据(例如来自Affymetrix Genechips)的功能,以测量转录本丰度和体系结构。软件包的主要功能是:1。代表线性数据的分区的类“分割”类“分割”;2.使用既快速又精确的动态编程算法拟合分段常数模型的函数“段”;3.使用StrucChange软件包计算置信区间的函数'contint';4.用于生成漂亮图的功能“ plotalongchrom”;5.从一组参考杂交的探针序列响应调整的函数'归一化差异。
作者:Wolfgang Huber,Zhenyu Xu,Joern Toedling,Matt Ritchie的贡献
维护者:zhenyu xu
引用(从r内,输入引用(“ tilingarray”)
):
要安装此软件包,请启动R并输入:
##尝试http://如果不支持https:// url不支持source(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ tilingarray”)
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Tillingarray”)
Ressionnorm.pdf | ||
costmatrix.pdf | ||
findsegments.pdf | ||
plotalongchrom.pdf | ||
分段.pdf | ||
参考手册 |
生物浏览 | 微阵列,,,,Onechannel,,,,预处理,,,,软件,,,,可视化 |
版本 | 1.32.0 |
在生物导体中 | Bioc 1.6(R-2.1)或更早(> 11年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | r(> = 2.11.0),生物酶, 方法,pixmap |
进口 | Strucchange,,,,副词,,,,VSN,,,,GeneFilter,,,,rcolorbrewer, 网格 |
链接 | |
建议 | |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | adacgh2,,,,David Tiling |
进口我 | Snapcgh |
建议我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
包源 | tilingarray_1.32.0.tar.gz |
Windows二进制 | tilingarray_1.32.0.zip(32-和64位) |
Mac OS X 10.6(雪豹) | |
Mac OS X 10.9(Mavericks) | |
颠覆源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/tilingarray/tree/release-2.9 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/tilingarray/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |