要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ ggbio”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

GGBIO

该包适用于生物导体的2.9版;对于稳定的最新版本,请参阅GGBIO

基因组数据的静态可视化。

生物导体版本:2.9

GGBIO软件包扩展并专门针对生物学数据的图形语法。这些图形旨在回答常见的科学问题,尤其是那些经常询问的高通量基因组数据。在适当的情况下,支持所有核心生物导体数据结构。该软件包支持特定基因组区域以及全基因组概述的详细观点。支持的概述包括意识形态图和宏伟的线性视图。高级图包括序列片段长度,与数据视图的边缘连锁间隔,不匹配堆积和几个剪接摘要。

作者:Tengfei Yin,Dianne Cook,Michael Lawrence

维护者:tengfei yin

引用(从r内,输入引用(“ GGBIO”)):

安装

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文档

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Browsevignettes(“ GGBIO”)

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PDF 参考手册

细节

生物浏览 生物信息学,,,,基础设施,,,,软件,,,,可视化
版本 1.0.4
在生物导体中 Bioc 2.9(R-2.14)(4。5年)
执照 艺术2.0
要看 方法,Biovizbase,,,,GGPLOT2
进口 方法,Biovizbase,,,,GGPLOT2,,,,iranges,,,,基因组机,,,,GenomicFeatures,,,,rsamtools,,,,BSGENOME,,,,栅格,,,,
链接
建议 bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg19
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 ggbio_1.0.4.4.tar.gz
Windows二进制 ggbio_1.0.4.4.zip
Mac OS X 10.6(雪豹)
Mac OS X 10.9(Mavericks)
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/ggbio/tree/release-2.9
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/ggbio/
软件包下载报告 下载统计

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