要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ charm”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

魅力

该包适用于生物导体的2.9版;对于稳定的最新版本,请参阅魅力

来自魅力微阵列的DNA甲基化数据的分析

生物导体版本:2.9

该软件包实现了使用Nimblegen微阵列和MCRBC协议生成的DNA甲基化数据的分析工具。它发现样品之间差异化甲基化区域,计算甲基化百分比,并包括阵列质量评估工具。

作者:Martin Aryee,Peter Murakami,Harris Jaffee,Srinivasan Yegnasubramanian,Rafael Irizarry

维护者:Martin Aryee 的Aryee>

引用(从r内,输入引用(“魅力”)):

安装

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文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“魅力”)

PDF charm.pdf
PDF 参考手册

细节

生物浏览 生物信息学,,,,DNAMETHYLATY,,,,微阵列,,,,软件
版本 1.6.0
在生物导体中 Bioc 2.6(R-2.11)(6年)
执照 LGPL(> = 2)
要看 r(> = 2.11.0),生物酶,,,,SQN,,,,字段,,,,rcolorbrewer,,,,GeneFilter
进口 BSGENOME,,,,生物酶,,,,奥利戈(> = 1.11.31),寡群(> = 1.9.42),ff,,,,预处理,方法,统计,生物弦,,,,iranges,,,,siggenes,,,,NOR1MIX,,,,gtools,grdevices,图形,utils
链接
建议 Charmdata,,,,bsgenome.hsapiens.ucsc.hg18
系统要求
增强
URL
取决于我 Charmdata
进口我
建议我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 charm_1.6.0.tar.gz
Windows二进制 charm_1.6.0.zip
Mac OS X 10.6(雪豹)
Mac OS X 10.9(Mavericks)
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/charm/tree/release-2.9
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/charm/
软件包下载报告 下载统计

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  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
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弗雷德·哈钦森癌症研究中心