要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“biovizBase”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。
这个包适用于Bioconductor 2.9版;有关稳定的最新发布版本,请参见biovizBase.
Bioconductor版本:2.9
biovizBase包旨在为基因组数据提供一套实用程序、配色方案和约定。它是生物数据可视化的各种高级包的基础。这节省了开发工作并鼓励一致性。
作者:尹腾飞,迈克尔·劳伦斯,黛安·库克
维护者:尹腾飞<尹腾飞at gmail.com>
引文(从R内,输入引用(“biovizBase”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“biovizBase”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“biovizBase”)
intro-shrink-single.pdf | ||
intro-shrinkageFun.pdf | ||
intro.pdf | ||
参考手册 |
biocViews | 生物信息学,基础设施,预处理,软件,可视化 |
版本 | 1.0.4 |
在Bioconductor | BioC 2.9 (R-2.14)(4.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R(>= 2.10),方法 |
进口 | 方法,尺度,RColorBrewer,二色视者,IRanges,GenomicRanges,Biostrings |
链接 | |
建议 | BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene,BSgenome,rtracklayer,GenomicFeatures,Rsamtools |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | ggbio |
进口我 | ggbio |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
包的来源 | biovizBase_1.0.4.tar.gz |
Windows二进制 | biovizBase_1.0.4.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | |
Mac OS X 10.9 (Mavericks) | |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/Bioconductor-mirror/biovizBase/tree/release-2.9 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/biovizBase/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |