要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“affy”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

affy

这个包适用于Bioconductor 2.9版;有关稳定的最新发布版本,请参见affy

Affymetrix寡核苷酸阵列方法

Bioconductor版本:2.9

该软件包包含用于探索性寡核苷酸阵列分析的功能。对tkWidgets的依赖只涉及少数方便函数。'affy'没有它也是完全有用的。

作者:Rafael A. Irizarry , Laurent Gautier , Benjamin Milo Bolstad , Crispin Miller 的贡献。astrazeneca.com>, Leslie M. Cope < Cope at mts.jhu.edu>, Robert Gentleman, Jeff Gentry, Conrad Halling , Wolfgang Huber, James MacDonald , Benjamin i.p. Rubinstein, Christopher Workman < Workman at cbs.dtu。dk>,张约翰

维护者:Rafael A. Irizarry

引文(从R内,输入引用(“affy”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“affy”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“affy”)

PDF affy.pdf
PDF builtinMethods.pdf
PDF customMethods.pdf
PDF vim.pdf
PDF 参考手册

细节

biocViews 微阵列OneChannel预处理软件
版本 1.32.1
在Bioconductor BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 11年)
许可证 LGPL (>= 2.0)
取决于 R (>= 2.8.0),Biobase(> = 2.5.5)
进口 affyio(> = 1.13.3),Biobase(> = 2.5.5),BiocInstaller,图形,grDevices,方法,preprocessCore,统计,utils,zlibbioc
链接 preprocessCore
建议 tkWidgets(> = 1.19.0),affydata
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我 affyContamaffycoretoolsaffydataAffyExpressaffylmGUIaffyParaaffypdnnaffyPLMaffyQCReportAgiMicroRnaALLMLLaltcdfenvsAmpAffyExamplearrayMvoutArrayToolsbgxbronchialIL13ccTutorial慢性淋巴细胞白血病CormotifdualKSecoliLeucine雌激素ExiMiR农场frmaToolsgcrmaLMGenelogitTLVSmiRNA时间的MAQCsubsetMAQCsubsetAFX中长期规划mvoutDatapanpplwPREDAsampledata彪马pumadataqpcrNormReadqPCRRefPlusrHVDMsimpleaffySpikeInSpikeInSubsetsscore斯塔尔webbiocXhybCasneuf
进口我 affyILMaffyQCReportAffyTilingArrayExpressarrayQualityMetricsArrayToolsCormotif农场frmagcrmaGEOsubmissionHarshlightHTqPCR光民makecdfenv钳子plw彪马pvacsimpleaffytilingArrayTurboNormvsn
建议我 AnnotationDbibeadarraybeadarraySNPBiocCaseStudiesBiostringsBufferedMatrixMethods雌激素ExpressionViewfactDesignffpeExampleDataGeneRegionScanlimmamade4oneChannelGUIPREDAsiggenesTurboNorm
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源 affy_1.32.1.tar.gz
Windows二进制 affy_1.32.1.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Mac OS X 10.9 (Mavericks)
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/affy/tree/release-2.9
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/affy/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心