安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“GGtools”)

在大多数情况下,您不需要下载包存档。

GGtools

这个包是2.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅GGtools

软件和数据的遗传基因表达(c) 2006 VJ凯莉

Bioconductor版本:2.9

人类基因组单体型图SNP处理报告,GWAS等等。

作者:文斯凯里< stvjc channing.harvard.edu >

维修工:文斯凯里< stvjc channing.harvard.edu >

从内部引用(R,回车引用(“GGtools”)):

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“GGtools”)

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“GGtools”)

PDF binf09supp.pdf
PDF external.pdf
PDF GGtools_2011.pdf
PDF lab2010.pdf
PDF 参考手册

细节

biocViews 生物信息学,GeneticVariability,遗传学,单核苷酸多态性,软件
版本 4.0.0
Bioconductor自 BioC 1.9 (r - 2.4)(9.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R(> = 2.13.0)、方法Biobase(> = 1.11.26),GGBase(> = 3.13.5),snpStats(> = 1.1.10),注释,IRanges,rtracklayer,org.Hs.eg.db,GenomicRanges(> = 1.3.38),ff
进口 AnnotationDbi,IRanges(> = 1.1.6),annaffy,rtracklayer,,Rsamtools
链接
建议 illuminaHumanv1.db,org.Hs.eg.db,SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20100427,rpart,rtracklayer,ceu1kg,SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20090506,筷子,GGdata,genefilter
SystemRequirements
增强了 多核
URL
取决于我 ceu1kg,cheung2010,encoDnaseI,ggtut
进口我 ceuhm3
建议我 hmyriB36,ind1KG
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源 GGtools_4.0.0.tar.gz
Windows二进制 GGtools_4.0.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Mac OS X 10.9(小牛)
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/bioconductor - mirror/ggtools/tree/release - 2.9
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/GGtools/
包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请阅读发布指南。文章质疑Bioconductor到以下位置:

  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心