安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“GEOquery”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
这个包是2.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅GEOquery。
Bioconductor版本:2.9
NCBI基因表达综合(GEO)是一个公共存储库的微阵列数据。鉴于该资源丰富多变的本性,它只是自然要BioConductor工具应用到这些数据。GEOquery是地理和BioConductor之间的桥梁。
作者:肖恩·戴维斯在mail.nih.gov > < sdavis2
维护人员:肖恩·戴维斯在mail.nih.gov > < sdavis2
从内部引用(R,回车引用(“GEOquery”)
):
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“GEOquery”)
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“GEOquery”)
GEOquery.pdf | ||
参考手册 |
biocViews | DataImport,微阵列,OneChannel,圣人,软件,TwoChannel |
版本 | 2.21.9 |
Bioconductor自 | BioC 1.8 (r - 2.3)(10年) |
许可证 | GPL-2 |
取决于 | 方法,Biobase |
进口 | XML,RCurl |
链接 | |
建议 | limma,RUnit |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://watson.nci.nih.gov/ sdavis |
取决于我 | dyebiasexamples,GEOmetadb |
进口我 | BeadArrayUseCases,SRAdb |
建议我 | dyebias,PGSEA |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
包的来源 | GEOquery_2.21.9.tar.gz |
Windows二进制 | GEOquery_2.21.9.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | |
Mac OS X 10.9(小牛) | |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/geoquery/tree/release - 2.9 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/GEOquery/ |
包下载报告 | 下载数据 |