安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“GEOquery”)

在大多数情况下,您不需要下载包存档。

GEOquery

这个包是2.9版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅GEOquery

从NCBI基因表达综合(GEO)获得数据

Bioconductor版本:2.9

NCBI基因表达综合(GEO)是一个公共存储库的微阵列数据。鉴于该资源丰富多变的本性,它只是自然要BioConductor工具应用到这些数据。GEOquery是地理和BioConductor之间的桥梁。

作者:肖恩·戴维斯在mail.nih.gov > < sdavis2

维护人员:肖恩·戴维斯在mail.nih.gov > < sdavis2

从内部引用(R,回车引用(“GEOquery”)):

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“GEOquery”)

文档

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browseVignettes (“GEOquery”)

PDF GEOquery.pdf
PDF 参考手册

细节

biocViews DataImport,微阵列,OneChannel,圣人,软件,TwoChannel
版本 2.21.9
Bioconductor自 BioC 1.8 (r - 2.3)(10年)
许可证 GPL-2
取决于 方法,Biobase
进口 XML,RCurl
链接
建议 limma,RUnit
SystemRequirements
增强了
URL http://watson.nci.nih.gov/ sdavis
取决于我 dyebiasexamples,GEOmetadb
进口我 BeadArrayUseCases,SRAdb
建议我 dyebias,PGSEA
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源 GEOquery_2.21.9.tar.gz
Windows二进制 GEOquery_2.21.9.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Mac OS X 10.9(小牛)
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/bioconductor - mirror/geoquery/tree/release - 2.9
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/GEOquery/
包下载报告 下载数据

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Bioconductor

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支持»

请阅读发布指南。文章质疑Bioconductor到以下位置:

  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网
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