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##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ geometadb”)
在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。
该包适用于生物导体的2.9版;对于稳定的最新版本,请参阅deogetAdb。
生物导体版本:2.9
NCBI基因表达综合(GEO)代表了微阵列数据的最大公共存储库。但是,使用当前工具找到感兴趣的数据可能会具有挑战性。GeometADB试图访问与样本,平台和数据集相关的元数据更可行。这是通过将所有NCBI GEO元数据解析为可以在本地存储和查询的SQLite数据库来完成的。GeometAdB只是围绕SQLite数据库的薄包装,以及关联的文档。最后,随着新数据添加到GEO,可以定期更新SQLITE数据库,并且可以随意下载最新的元数据。geometAdb论文:http://bioinformatics.oxfordjournals.org/cgi/content/short/short/24/23/2798。
作者:杰克·朱和肖恩·戴维斯
维护者:jack zhu
引用(从r内,输入引用(“ quemetAdb”)
):
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##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ geometadb”)
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ quemetAdb”)
geometadb.pdf | ||
geometadb_diagram.pdf | ||
参考手册 |
生物浏览 | 基础设施,,,,软件 |
版本 | 1.14.2 |
在生物导体中 | Bioc 2.2(R-2.7)(8年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | 地球,,,,rsqlite |
进口 | |
链接 | |
建议 | |
系统要求 | |
增强 | |
URL | http://gbnci.abcc.ncifcrf.gov/geo/ |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
包源 | geometadb_1.14.2.tar.gz |
Windows二进制 | geometadb_1.14.2.zip |
Mac OS X 10.6(雪豹) | |
Mac OS X 10.9(Mavericks) | |
颠覆源 | (用户名/密码:ReadOnly) |
git源 | https://github.com/bioconductor-mirror/geometadb/tree/release-2.9 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/geometadb/ |
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