要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ geometadb”)

在大多数情况下,您根本不需要下载包装存档。

deogetAdb

该包适用于生物导体的2.9版;对于稳定的最新版本,请参阅deogetAdb

NCBI GEO的元数据汇编

生物导体版本:2.9

NCBI基因表达综合(GEO)代表了微阵列数据的最大公共存储库。但是,使用当前工具找到感兴趣的数据可能会具有挑战性。GeometADB试图访问与样本,平台和数据集相关的元数据更可行。这是通过将所有NCBI GEO元数据解析为可以在本地存储和查询的SQLite数据库来完成的。GeometAdB只是围绕SQLite数据库的薄包装,以及关联的文档。最后,随着新数据添加到GEO,可以定期更新SQLITE数据库,并且可以随意下载最新的元数据。geometAdb论文:http://bioinformatics.oxfordjournals.org/cgi/content/short/short/24/23/2798。

作者:杰克·朱和肖恩·戴维斯

维护者:jack zhu

引用(从r内,输入引用(“ quemetAdb”)):

安装

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##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ geometadb”)

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ quemetAdb”)

PDF geometadb.pdf
PDF geometadb_diagram.pdf
PDF 参考手册

细节

生物浏览 基础设施,,,,软件
版本 1.14.2
在生物导体中 Bioc 2.2(R-2.7)(8年)
执照 艺术2.0
要看 地球,,,,rsqlite
进口
链接
建议
系统要求
增强
URL http://gbnci.abcc.ncifcrf.gov/geo/
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

包源 geometadb_1.14.2.tar.gz
Windows二进制 geometadb_1.14.2.zip
Mac OS X 10.6(雪豹)
Mac OS X 10.9(Mavericks)
颠覆源 (用户名/密码:ReadOnly)
git源 https://github.com/bioconductor-mirror/geometadb/tree/release-2.9
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/geometadb/
软件包下载报告 下载统计

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