##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“Biostrings”)

这个包适用于Bioconductor 2.9版;有关稳定的最新发布版本，请参见Biostrings．

表示生物序列的字符串对象，以及匹配算法

Bioconductor版本:2.9

内存高效的字符串容器，字符串匹配算法和其他实用程序，用于快速操作大型生物序列或序列集。

作者:H.佩奇，P. Aboyoun, R. Gentleman, S. DebRoy

维护:H. Pages

安装

要安装这个包，启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“Biostrings”)

文档

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browseVignettes(“Biostrings”)

PDF		Alignments.pdf
PDF		Biostrings2Classes.pdf
PDF		matchprobes.pdf
PDF		MultipleAlignments.pdf
PDF		参考手册

细节

biocViews	DataImport，DataRepresentation，遗传学，基础设施，SequenceMatching，测序，软件
版本	2.22.0
在Bioconductor	BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 11年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(>= 2.8.0)，方法，IRanges(> = 1.11.34)
进口	图形，方法，统计，utils，IRanges
链接	IRanges
建议	BSgenome(> = 1.13.14),BSgenome.Celegans.UCSC.ce2(> = 1.3.11),BSgenome.Dmelanogaster.UCSC.dm3(> = 1.3.11),drosophila2probe，hgu95av2probe，hgu133aprobe，GenomicFeatures(> = 1.3.14),hgu95av2cdf，affy，affydata(> = 1.11.5),RUnit
SystemRequirements
增强了	Rmpi
URL
全靠我	altcdfenvs，BSgenome，ChIPpeakAnno，ChIPsim，解读，GeneRegionScan，harbChIP，methVisual，oneChannelGUI，R453Plus1Toolbox，REDseq，rGADEM，Rsamtools，seqbias，ShortRead，VariantAnnotation
进口我	AffyCompatible，ArrayExpressHTS，BCRANK，BioSeqClass，biovizBase，魅力，ChIPpeakAnno，ChIPseqR，ChIPsim，解读，gcrma，GeneRegionScan，GenomicFeatures，genoset，girafe，MEDIPS，MEDME，methVisual，微，益生元，oligoClasses，OTUbase，pd.081229.hg18.promoter.medip.hx1，pd.2006.07.18.hg18.refseq.promoter，pd.2006.07.18.mm8.refseq.promoter，pd.2006.10.31.rn34.refseq.promoter，pd.ag，pd.ath1.121501，pd.barley1，pd.bovine，pd.bsubtilis，pd.canine，pd.canine.2，pd.celegans，pd.charm.hg18.example，pd.chicken，pd.citrus，pd.cotton，pd.cytogenetics.array，pd.drosgenome1，pd.drosophila.2，pd.e.coli.2，pd.ecoli，pd.ecoli.asv2，pd.feinberg.hg18.me.hx1，pd.feinberg.mm8.me.hx1，pd.genomewidesnp.5，pd.genomewidesnp.6，pd.hc.g110，pd.hg.focus，pd.hg.u133.plus.2，pd.hg.u133a，pd.hg.u133a.2，pd.hg.u133a.tag，pd.hg.u133b，pd.hg.u219，pd.hg.u95a，pd.hg.u95av2，pd.hg.u95b，pd.hg.u95c，pd.hg.u95d，pd.hg.u95e，pd.ht.hg.u133.plus.pm，pd.ht.hg.u133a，pd.ht.mg.430a，pd.hu6800，pd.huex.1.0.st.v2，pd.hugene.1.0.st.v1，pd.hugene.1.1.st.v1，pd.maize，pd.mapping250k.nsp，pd.mapping250k.sty，pd.mapping50k.hind240，pd.mapping50k.xba240，pd.medicago，pd.mg.u74a，pd.mg.u74av2，pd.mg.u74b，pd.mg.u74bv2，pd.mg.u74c，pd.mg.u74cv2，pd.mirna.1.0，pd.moe430a，pd.moe430b，pd.moex.1.0.st.v1，pd.mogene.1.0.st.v1，pd.mogene.1.1.st.v1，pd.mouse430.2，pd.mouse430a.2，pd.mu11ksuba，pd.mu11ksubb，pd.pae.g1a，pd.plasmodium.anopheles，pd.poplar，pd.porcine，pd.rae230a，pd.rae230b，pd.raex.1.0.st.v1，pd.ragene.1.0.st.v1，pd.ragene.1.1.st.v1，pd.rat230.2，pd.rg.u34a，pd.rg.u34b，pd.rg.u34c，pd.rhesus，pd.rice，pd.rn.u34，pd.s.aureus，pd.soybean，pd.sugar.cane，pd.tomato，pd.u133.x3p，pd.vitis.vinifera，pd.wheat，pd.x.laevis.2，pd.x.tropicalis，pd.xenopus.laevis，pd.yeast.2，pd.yg.s98，pd.zebrafish，pdInfoBuilder，R453Plus1Toolbox，REDseq，rGADEM，Rolexa，Rsamtools，rtracklayer，ShortRead
建议我	注释，BeadArrayUseCases，CSAR，exomeCopy，GenomicFeatures，微，procoil，SLGI，SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20090506，SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20100427，SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20101109，SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20110815
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

包的来源	Biostrings_2.22.0.tar.gz
Windows二进制	Biostrings_2.22.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Mac OS X 10.9 (Mavericks)
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/Bioconductor-mirror/Biostrings/tree/release-2.9
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/Biostrings/
软件包下载报告	下载数据