要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("Biobase")

在大多数情况下,您根本不需要下载包存档。

Biobase

此包适用于Bioconductor的2.9版本;有关稳定的最新发布版本,请参见Biobase

Biobase: Bioconductor的基本功能

Bioconductor版本:2.9

许多其他包需要的函数或替换R函数的函数。

作者:R.绅士,V.凯里,M.摩根,S.福尔肯

维护者:Bioconductor包维护者< Bioconductor .org>的维护者

引用(从R中,输入引用(“Biobase”)):

安装

要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("Biobase")

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“Biobase”)

PDF BiobaseDevelopment.pdf
PDF Bioconductor.pdf
PDF esApply.pdf
PDF ExpressionSetIntroduction.pdf
PDF HowTo.pdf
PDF Qviews.pdf
PDF 参考手册

细节

biocViews 生物信息学基础设施软件
版本 2.14.0
Bioconductor自 BioC 1.6 (R-2.1)或更早版本(> 11年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 2.10), utils
进口 方法
链接
建议 工具,tkWidgets所有
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我 a4Basea4CoreACMEaffyaffycompaffycompDataaffyContamaffycoretoolsaffylmGUIaffyPLMaffyQCReportAGDEXAgi4x44PreProcessAgiMicroRna所有altcdfenvsannaffyAnnotationDbiArrayExpressarrayMvoutArrayToolsbeadarraybeadarrayExampleDatabeadarraySNPbgxBicAREBiocCaseStudiesbioDistBioMVCClass生命网络bladderbatch类别亚兰cellHTScellHTS2ceu1kgceuhm3CGHbaseCGHcallCGHregions魅力cheung2010clippda慢性淋巴细胞白血病clusterStabCMAcn.farmscn.mopscodelinkcolonCA转换国王杯crlmmdavidTilingddCtDESeqDEXSeqDFPDLBCLdressCheckdualKSdyebiasEBarraysEDASeqeddeisaencoDnaseIExiMiRfactDesignfibroEsetflowClustflowCoreflowWorkspacefrmagagagaschYHSGeneAnswersGeneExpressionSignatureGeneMetageneplottergeneRecommenderGeneRegionScanGeneSelectMMDGeneSelectorgenosetGEOqueryGGBaseGGdataGGtoolsGOFunctiongolubEsetsgoProfilesGOstatsGSEABaseGSEAlmGSVAdataGWASToolsharbChIP帮助hmyriB36hopachHTqPCRhtSeqToolshumanStemCell染色体组型inSilicoDb等压线iterativeBMAIyer517kidpackleeBamViewsLMGene光民lumiBarneslungExpressionLVSmiRNAmacat时间的MAQCsubsetMAQCsubsetAFXMAQCsubsetILMmaSigProMergeMaidmethylumiMfuzzMiChipminfiMLInterfacesMmPalateMiRNAMSnbaseMulcommvoutDataNeve2006NormqPCR诊断oligoClassesoneChannelGUIontoToolsOrderedListOTUbaseOutlierDPAnnBuilderpanppcaMethodspcot2pdInfoBuilderpdmclassPGSEAphenoTestplgemPLPE普拉达PREDAPREDAsampledataProData承诺彪马pumadataqpcrNormR453Plus1ToolboxRbcBook1rbsurvReadqPCR犹太人的尊称RefPlusResourcererrHVDM林格RMAGEMLRmagpierMATRNAinteractrnaSeqMapRpsiXMLrqubicRTCARTools4TBRTopperRtreemix安全siggenessimpleaffySNPchipSpeCondSpikeInSubsetspkToolssplicegearTDARACNEtigretilingArraytopGOtspairtweeDEseqCountData《暮光之城》vsnwebbiocXDEyeastCC
进口我 ABarrayaCGHadSplitaffyaffyILMaffyQCReportAgiMicroRna注释AnnotationDbiannotationToolsArrayExpressHTSarrayQualityMetricsArrayTools吸引betrbiocViewsBioSeqClass类别ccTutorialCGHnormaliter魅力ChromHeatMapConsensusClusterPlus周期EBarraysecolitkENCODEFig4Band4DExiMiR农场flowCoreflowFlowJoflowFPflowMeansflowStatsflowTypeflowUtilsflowVizflowWorkspacefrmafrmaToolsgcrmagenefilterGeneMetageneplottergeneRecommenderGeneRegionScanGeneSelectMMDgenomeIntervalsGenomicFeaturesgenosetGEOsubmissiongirafeglobaltestGOFunctionGOstatsGSEABaseGSRIGSVAHarshlight哼哼hopachHTqPCRiFlowimageHTSlapmixLiquidAssociation光民maanovamakecdfenvmaSigPromBPCRMCRestimatemetaArraymethylumiMiChipMiPPMmPalateMiRNA多屏幕mzRncdfFlow诊断益生元OrderedListPAnnBuilderpanpPCphenoplateCore钳子ppiStats普拉达承诺彪马pvacqpgraphR453Plus1ToolboxrandPackReadqPCRRmagpierMATrqubicRtreemix安全SAGxShortReadsimpleaffySLGISNPchipspkToolssplicegearTEQCtigretimecoursetopGOTSSi《暮光之城》VanillaICEVariantAnnotationwebbiocXDExmapcore
建议我 注释betrBiocCaseStudiesbiocViewsbreastCancerMAINZbreastCancerNKIbreastCancerTRANSBIGbreastCancerUNTbreastCancerUPPbreastCancerVDXBSgenome类别ccTutorialdyebiasexamples雌激素农场genefiltergeneplotterGlobalAncovaglobaltestHeatplus莱斯nempkgDepToolsrheumaticConditionWOLLBOLD中华民国survcomptkWidgetsvbmpwidgetToolsyeastExpDatayeastRNASeq
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

包的来源 Biobase_2.14.0.tar.gz
Windows二进制 Biobase_2.14.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6(雪豹)
Mac OS X 10.9(小牛队)
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/Bioconductor-mirror/Biobase/tree/release-2.9
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/Biobase/
包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请阅读发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下地点之一:

  • 支持网站-有关Bioconductor包装的问题
  • 正常词 邮件列表——用于包开发人员bob电竞体育官网
弗雷德·哈钦森癌症研究中心