安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“vsn”)

在大多数情况下,您不需要下载包存档。

vsn

这个包是2.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅vsn

微阵列数据的方差稳定化和校准

Bioconductor版本:2.8

包实现了正常化芯片强度的方法,内部之间的颜色数组,和数组之间。该方法使用一个健壮的变异最大似然估计量的微阵列数据的随机模型中描述的引用(见小插图)。模型包含数据校准(又名归一化),一个模型的依赖强度均值方差,方差稳定数据转换。差异转化强度类似于“log-ratios正常化”。然而,与后者相比,他们的方差是独立的意思是,他们通常更敏感和具体检测微分转录。

作者:沃尔夫冈•休伯从安雅•冯•Heydebreck与贡献。许多用户的评论和建议都承认,其中丹尼斯Kostka,大卫•Kreil汉斯克莱因,罗伯特先生,Deepayan Sarkar和戈登·史密斯。

维修工:沃尔夫冈·胡贝尔<胡贝尔在ebi.ac.uk >

从内部引用(R,回车引用(“vsn”)):

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“vsn”)

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“vsn”)

PDF convergence2.pdf
PDF likelihoodcomputations.pdf
PDF vsn.pdf
PDF 参考手册

细节

biocViews 微阵列,OneChannel,预处理,软件,TwoChannel
版本 3.20.0
Bioconductor自 BioC 1.6 (r - 2.1)或更早(> 11年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 Biobase(> = 2.5.5)
进口 方法,affy(> = 1.23.4),limma,晶格
链接
建议 affydata,hgu95av2cdf
SystemRequirements
增强了
URL http://www.r-project.orghttp://www.ebi.ac.uk/huber
取决于我 affyPara,cellHTS2,LVSmiRNA,webbioc
进口我 arrayQualityMetrics,imageHTS,林格,tilingArray
建议我 adSplit,Agi4x44PreProcess,beadarray,BiocCaseStudies,cellHTS,雌激素,GlobalAncova,globaltest,limma,光民,MSnbase,《暮光之城》
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源 vsn_3.20.0.tar.gz
Windows二进制 vsn_3.20.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Mac OS X 10.9(小牛)
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/bioconductor - mirror/vsn/tree/release - 2.8
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/vsn/
包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请阅读发布指南。文章质疑Bioconductor到以下位置:

  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心