安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“snapCGH”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
这个包是2.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅snapCGH。
Bioconductor版本:2.8
分段的方法,正常化和处理aCGH数据;包括绘图函数想象原始和单个和多个分段数据数组。
作者:迈克·l·史密斯,约翰·c·Marioni史蒂文·麦金尼托马斯•Hardcastle娜塔莉·p·索恩
维护人员:约翰Marioni < Marioni uchicago.edu >
从内部引用(R,回车引用(“snapCGH”)
):
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# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“snapCGH”)
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browseVignettes (“snapCGH”)
snapCGHguide.pdf | ||
参考手册 |
biocViews | CopyNumberVariants,微阵列,预处理,软件,TwoChannel |
版本 | 1.22.0 |
Bioconductor自 | BioC 1.8 (r - 2.3)(10年) |
许可证 | GPL |
取决于 | limma,DNAcopy、方法 |
进口 | aCGH,集群,DNAcopy,很高兴、图形、grDeviceslimma、方法、统计数据tilingArray,跑龙套 |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | ADaCGH2 |
进口我 | |
建议我 | beadarraySNP |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
包的来源 | snapCGH_1.22.0.tar.gz |
Windows二进制 | snapCGH_1.22.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | |
Mac OS X 10.9(小牛) | |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/snapcgh/tree/release - 2.8 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/snapCGH/ |
包下载报告 | 下载数据 |