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这个包是2.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅simpleaffy。

非常简单的Affymetrix数据的高级分析

Bioconductor版本:2.8

提供高级功能阅读Affy .CEL文件,表型数据,然后计算简单的事情,如t、褶皱等变化。使大量使用affy库。也有一些基本的散点图功能和机制生成高分辨率数字杂志……

作者:Crispin J·米勒

维护人员:Crispin米勒< cmiller在picr.man.ac.uk >

安装

安装这个包,开始R和输入:

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文档

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browseVignettes (“simpleaffy”)

PDF		QCandSimpleaffy.pdf
PDF		simpleAffy.pdf
PDF		参考手册

细节

biocViews	注释,生物信息学,DataImport,DifferentialExpression,微阵列,OneChannel,预处理,质量控制,ReportWriting,软件,转录,可视化
版本	2.28.0
Bioconductor自	BioC 1.6 (r - 2.1)或更早(> 11年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 2.0.0),affy,genefilter,Biobase、方法、跑龙套gcrma
进口	affy,Biobase,gcrma,genefilter,图形,grDevices,方法,属性,跑龙套
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL	//www.anjoumacpherson.comhttp://bioinformatics.picr.man.ac.uk/simpleaffy/
取决于我	yaqcaffy
进口我	affyQCReport,arrayMvout,arrayQualityMetrics
建议我	AffyExpress,ArrayTools
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	simpleaffy_2.28.0.tar.gz
Windows二进制	simpleaffy_2.28.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Mac OS X 10.9(小牛)
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/simpleaffy/tree/release - 2.8
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/simpleaffy/
包下载报告	下载数据