安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“rGADEM”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
这个包是2.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅rGADEM。
Bioconductor版本:2.8
rGADEM是一种有效的新创主题发现大规模基因组序列数据的工具。它是一个开源R包,它是基于GADEM软件。
作者:Arnaud所有权,拉斐尔Gottardo戈登·罗伯逊和莱普
维护人员:Arnaud所有权< Arnaud。所有权在ircm.qc.ca >
从内部引用(R,回车引用(“rGADEM”)
):
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“rGADEM”)
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“rGADEM”)
rGADEM.pdf | ||
参考手册 |
biocViews | ChIPSeq,ChIPchip,GenomicSequence,微阵列,测序,软件 |
版本 | 1.4.0 |
Bioconductor自 | BioC 2.6 (r - 2.11)(6年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (> = 2.11.0),Biostrings,IRanges,BSgenome、方法、seqLogo |
进口 | Biostrings,IRanges、方法、图形seqLogo |
链接 | |
建议 | BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | MotIV |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
包的来源 | rGADEM_1.4.0.tar.gz |
Windows二进制 | rGADEM_1.4.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | |
Mac OS X 10.9(小牛) | |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/rgadem/tree/release - 2.8 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/rGADEM/ |
包下载报告 | 下载数据 |