安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“qrqc”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
这个包是2.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅qrqc。
Bioconductor版本:2.8
快速扫描读取并收集统计基础和质量频率,读取长度和频繁序列。生产统计图形输出用于质量控制管道,和一个可选的HTML质量报告。S4 SequenceSummary对象允许特定的测试和功能写在收集的数据。
作者:文斯水牛
维修工:文斯水牛< vsbuffalo ucdavis.edu >
从内部引用(R,回车引用(“qrqc”)
):
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“qrqc”)
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“qrqc”)
qrqc.pdf | ||
参考手册 |
biocViews | DataImport,HighThroughputSequencing,预处理,质量控制,测序,软件,可视化 |
版本 | 1.0.0 |
Bioconductor自 | BioC 2.8 (r - 2.13)(5年) |
许可证 | GPL (> = 2) |
取决于 | Rsamtools(> = 1.3.28)、方法、工具,跑龙套 |
进口 | 重塑,酿造,xtable,testthat |
链接 | Rsamtools |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://bioinformatics.ucdavis.edu |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
包的来源 | qrqc_1.0.0.tar.gz |
Windows二进制 | qrqc_1.0.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | |
Mac OS X 10.9(小牛) | |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/qrqc/tree/release - 2.8 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/qrqc/ |
包下载报告 | 下载数据 |