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这个包是2.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅panp。

从负链匹配Probesets Presence-Absence调用

Bioconductor版本:2.8

使基因的存在/没有调用函数基于距离负链匹配probesets (NSMP)来自Affymetrix注释。PANP应用创建后基因表达值,因此可以使用任何预处理方法如MAS5或GCRMA之后,或者像RMA PM-only方法。HGU133A NSMP集已建立,hgu133 - + - 2.0芯片组。

作者:彼得·沃伦

维护人员:华伦<彼得。沃伦在verizon.net >

安装

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文档

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PDF		panp.pdf
PDF		参考手册

细节

biocViews	基础设施,软件
版本	1.22.0
Bioconductor自	BioC 1.8 (r - 2.3)(10年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 2.5.0),affy(> = 1.23.4),Biobase(> = 2.5.5)
进口	Biobase、方法、统计跑龙套
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	panp_1.22.0.tar.gz
Windows二进制	panp_1.22.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Mac OS X 10.9(小牛)
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/panp/tree/release - 2.8
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/panp/
包下载报告	下载数据