# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“oneChannelGUI”)

这个包是2.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅oneChannelGUI。

这个包扩展affylmGUI图形界面的功能。Affymetrix 3 '看,基因外显子数组实际上是实现togheter Illumina公司,GEO矩阵系列文件和标签分隔的文件。下一代测序二级分析ncRNA量化也是可用的。

Bioconductor版本:2.8

这个包是简化开发使用Bioconductor工具对初学者有有限或没有经验编写R代码。这个库提供了一个图形界面的微阵列基因外显子水平分析以及基本二级ncRNA门店数据量化分析。

作者:Raffale Calogero,生物信息学和基因组学的单位,部门的临床和生物科学都灵(意大利)

维护人员:拉斐尔Calogero <拉斐尔。在unito.it calogero >

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“oneChannelGUI”)

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“oneChannelGUI”)

PDF		fignew42.pdf
PDF		install.pdf
PDF		NGS.pdf
PDF		oneChannelGUI.pdf
PDF		standAloneFunctions.pdf
PDF		whatIsNew.pdf
PDF		参考手册

细节

biocViews	DataImport,DifferentialExpression,GUI,HighThroughputSequencing,微阵列,MultipleComparisons,OneChannel,预处理,质量控制,RNAseq,软件,统计数据
版本	1.18.7
Bioconductor自	BioC 2.0 (r - 2.5)(9年)
许可证	艺术许可证,2.0版
取决于	Biobase,limma,affylmGUI,tkWidgets,GOstats,AnnotationDbi,preprocessCore,IRanges,刨边机,baySeq,girafe
进口
链接
建议	注释,genefilter,maSigPro,pamr,pdmclass,ChIPpeakAnno,chipseq,BSgenome,Rgraphviz,affy,annaffy,affyPLM,乘,ssize,sizepower,siggenes,RankProd,org.Hs.eg.db,org.Mm.eg.db,org.Rn.eg.db,metaArray,MergeMaid,biomaRt,GenomeGraphs,AffyCompatible,Biostrings,IRanges,rtracklayer,Genominator,hugene10sttranscriptcluster.db,mogene10sttranscriptcluster.db,ragene10sttranscriptcluster.db,HuExExonProbesetLocation,MoExExonProbesetLocation,RaExExonProbesetLocation,雪,RmiR,RmiR.Hs.miRNA
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.bioinformatica.unito.it/oneChannelGUI/
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	oneChannelGUI_1.18.7.tar.gz
Windows二进制	oneChannelGUI_1.18.7.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Mac OS X 10.9(小牛)
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/onechannelgui/tree/release - 2.8
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/oneChannelGUI/
包下载报告	下载数据