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这个包是2.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅乘。

Resampling-based多重假设检验

Bioconductor版本:2.8

非参数引导和排列resampling-based多个测试程序(包括经验贝叶斯方法)控制family-wise错误率(弗兰克-威廉姆斯),广义family-wise错误率(gfw),尾概率的假阳性的比例(TPPFP)和错误发现率(罗斯福)。几种选择bootstrap-based空分布实现(集中、集中和缩放,quantile-transformed)。单步和步进式方法是可用的。测试基于各种t -统计量(包括t基于从线性回归参数和生存模型以及基于相关参数)。探索假设t统计量时,用户也可以选择一个潜在的速度零是多元正态分布的平均值为零,方差协方差矩阵向量的影响函数。结果报道在假定值调整方面,信心地区和检验统计量。程序直接适用于识别差异表达基因在DNA微阵列实验。

作者:凯瑟琳·s·波拉德,休斯顿n . Gilbert Yongchao通用电气、桑德拉·泰勒,Sandrine Dudoit

维护人员:凯瑟琳·s·波拉德< kpollard gladstone.ucsf.edu >

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PDF		参考手册

细节

biocViews	DifferentialExpression,微阵列,MultipleComparisons,软件
版本	2.8.0
Bioconductor自	BioC 1.6 (r - 2.1)或更早(> 11年)
许可证	LGPL
取决于	R(> = 2.9.0)、方法Biobase
进口	生存,质量
链接
建议	雪
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	a4Base,aCGH,BicARE,ChIPpeakAnno,计,KCsmart,LMGene,SAGx,siggenes,webbioc
进口我	ABarray,aCGH,adSplit,anota,ChIPpeakAnno,GeneSelector,globaltest,IsoGeneGUI,OCplus,webbioc
建议我	annaffy,BiocCaseStudies,ecolitk,GeneSelector,GOstats,GSEAlm,maigesPack,oneChannelGUI,pcot2,安全,SSPA,topGO,xcms
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	multtest_2.8.0.tar.gz
Windows二进制	multtest_2.8.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Mac OS X 10.9(小牛)
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/multtest/tree/release - 2.8
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/multtest/
包下载报告	下载数据