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这个包是2.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅limma。

微阵列数据的线性模型

Bioconductor版本:2.8

数据分析,微阵列数据的线性模型和微分表达式。

作者:戈登·史密斯与马修·里奇贡献杰里米银、詹姆斯•Wettenhall娜塔莉·索恩,Mette Langaas,埃吉尔Ferkingstad,马库斯戴维,弗朗索瓦•Pepin Dongseok崔戴维斯麦卡锡,Di,艾丽西亚Oshlack,卡罗琳格拉夫,易纺,魏史和贝琳达Phipson。

维护人员:戈登史密斯<史密斯在wehi.edu.au >

安装

安装这个包,开始R和输入:

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文档

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PDF		limma.pdf
PDF		usersguide.pdf
PDF		参考手册

细节

biocViews	生物信息学,DataImport,DifferentialExpression,微阵列,MultipleComparisons,OneChannel,预处理,质量控制,软件,TimeCourse,TwoChannel
版本	3.8.3
Bioconductor自	BioC 1.6 (r - 2.1)或更早(> 11年)
许可证	LGPL
取决于	R (> = tripwire)方法
进口
链接
建议	affy,质量,org.Hs.eg.db样条函数,statmod(> = 1.2.2),vsn
SystemRequirements
增强了
URL	http://bioinf.wehi.edu.au/limma
取决于我	a4Base,AffyExpress,affylmGUI,Agi4x44PreProcess,AgiMicroRna,吸引,CALIB,亚兰,cghMCR,ChIPpeakAnno,clippda,codelink,转换,coRNAi,HTqPCR,limmaGUI,LVSmiRNA,时间的,maigesPack,marray,nem,oneChannelGUI,qpcrNorm,林格,RMAGEML,RTools4TB,snapCGH,TurboNorm
进口我	affycoretools,ArrayExpress,arrayQuality,arrayQualityMetrics,ArrayTools,吸引,beadarray,betr,CALIB,ChIPpeakAnno,刨边机,explorase,GeneSelector,HTqPCR,iChip,maSigPro,奥林,PatientGeneSets,phenoTest,林格,RNAinteract,RNAither,snapCGH,SSPA,timecourse,vsn
建议我	ABarray,beadarraySNP,BiocCaseStudies,生命网络,类别,CMA,dyebias,GeneSelector,GEOquery,GSRI,GSVA,莱斯,光民,methylumi,中长期规划,益生元,PGSEA,plw,彪马,rtracklayer
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	limma_3.8.3.tar.gz
Windows二进制	limma_3.8.3.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Mac OS X 10.9(小牛)
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/limma/tree/release - 2.8
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/limma/
包下载报告	下载数据