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这个包是2.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅eisa。

通过迭代签名算法表达数据分析

Bioconductor版本:2.8

迭代签名算法(ISA)是一个biclustering方法;找到相关的块(转录模块)基因表达的数据(或其他表格)。ISA能够找到重叠模块和噪音是有弹性的。这个包提供了一个方便的ISA接口,使用标准BioConductor数据结构;也包含各种可视化工具,可以用于其他biclustering算法。

作者:伽柏Csardi <伽柏。在unil.ch Csardi >

维护人员:伽柏Csardi <伽柏。在unil.ch Csardi >

安装

安装这个包,开始R和输入:

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文档

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browseVignettes (eisa)

PDF		EISA_biclust.pdf
PDF		EISA_tutorial.pdf
PDF		参考手册

细节

biocViews	分类,GeneExpression,微阵列,软件,可视化
版本	1.4.1
Bioconductor自	BioC 2.6 (r - 2.11)(6年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	方法,isa2,Biobase,AnnotationDbi,类别,genefilter,DBI
进口
链接
建议	igraph(> = 0.5.2),矩阵,GOstats,GO.db,KEGG.db,biclust,质量,xtable,所有,hgu95av2.db
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我	ExpressionView
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	eisa_1.4.1.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Mac OS X 10.9(小牛)
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/eisa/tree/release - 2.8
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/eisa/
包下载报告	下载数据