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这个包是2.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅刨边机。

数字在R基因表达数据的实证分析

Bioconductor版本:2.8

微分表达式RNA-seq和数字基因表达谱分析与生物复制。使用经验贝叶斯估计和准确的测试基于负二项分布。也用于微分信号分析与其他类型公司的统计数据。

作者:马克·罗宾逊在wehi.edu.au > < mrobinson戴维斯麦卡锡在wehi.edu.au > < dmccarthy,戈登史密斯<史密斯在wehi.edu.au >

维护人员:马克·罗宾逊在wehi.edu.au > < mrobinson,戴维斯麦卡锡在wehi.edu.au > < dmccarthy,戈登史密斯<史密斯在wehi.edu.au >

安装

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文档

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PDF		edgeR.pdf
PDF		edgeR_case_study_Li_MDSplot.pdf
PDF		edgeR_case_study_longSAGE_MDSplot.pdf
PDF		edgeR_case_study_Tuch_MDSplot.pdf
PDF		参考手册

细节

biocViews	生物信息学,DifferentialExpression,HighThroughputSequencing,RNAseq,圣人,软件
版本	2.2.6款
Bioconductor自	BioC 2.3 (r - 2.8)(7.5年)
许可证	LGPL (> = 2)
取决于	R (> = tripwire)方法
进口	limma
链接
建议	质量,statmod,样条函数
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	oneChannelGUI
进口我	ArrayExpressHTS,rnaSeqMap
建议我	goseq,leeBamViews
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	edgeR_2.2.6.tar.gz
Windows二进制	edgeR_2.2.6.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Mac OS X 10.9(小牛)
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/edger/tree/release - 2.8
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/edgeR/
包下载报告	下载数据