安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (ddCt)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
这个包是2.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅ddCt。
Bioconductor版本:2.8
Delta-Delta-Ct (ddCt)算法是一种近似方法来确定相对基因表达定量实时PCR(存在)的实验。与其他方法相比,它不需要为每个primer-target双标准曲线,因此减少工作负荷,但返回足够精确的结果只要扩增效率的假设。ddCt包实现了管道收集,分析和可视化中存在的结果,例如来自TaqMan SDM软件,主要使用ddCt方法。管道可以通过在命令行或脚本API调用由S4-Classes、方法和功能。
作者:大卫•张Jitao鲁道夫Biczok和马库斯Ruschhaupt
维修工:Jitao大卫张< j。张在dkfz.de >
从内部引用(R,回车引用(ddCt)
):
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (ddCt)
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (ddCt)
RT-PCR-Script-ddCt.pdf | ||
rtPCR-usage.pdf | ||
rtPCR.pdf | ||
参考手册 |
biocViews | DifferentialExpression,GeneExpression,rt - pcr,软件 |
版本 | 1.6.0 |
Bioconductor自 | BioC 2.5 (r - 2.10)(6.5年) |
许可证 | LGPL-3 |
取决于 | R (> = tripwire),Biobase(> = 1.10.0),RColorBrewer(0.1 > = 3),xtable,晶格、方法 |
进口 | |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
包的来源 | ddCt_1.6.0.tar.gz |
Windows二进制 | ddCt_1.6.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | |
Mac OS X 10.9(小牛) | |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/ddct/tree/release - 2.8 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/ddCt/ |
包下载报告 | 下载数据 |