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这个包是2.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅科兹摩。

监督检测DNA序列的守恒的图案

Bioconductor版本:2.8

cosmo搜索一组未对齐的DNA序列对于可能的一个共同的主题,例如,是一个常见的转录因子结合位点。文化基因算法类似,但也允许用户指定的一组约束的位置权重矩阵未知的主题必须满足。这些约束可能包括边界的信息内容在某些地区未知的主题,例如,往往制定先验知识的基础上对转录因子的结构问题。未知的主题宽度、主题事件的分布(哎呀,调制噪声或中医),以及可以选择适当的约束集data-adaptively。

作者:奥利弗Bembom,费边背带,Sandrine Dudoit

维护人员:奥利弗Bembom <奥利弗。在gmail.com bembom >

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文档

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PDF		cosmo.pdf
PDF		参考手册

细节

biocViews	SequenceMatching,软件
版本	1.18.0
Bioconductor自	BioC 2.0 (r - 2.5)(9年)
许可证	文件许可
取决于	R(> =测试盒框)、方法、效用,seqLogo
进口
链接
建议	cosmoGUI
SystemRequirements
增强了
URL	http://cosmoweb.berkeley.edu/intro.htmlhttp://www.bepress.com/sagmb/vol6/iss1/art8
取决于我	cosmoGUI
进口我
建议我	马赛克
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	cosmo_1.18.0.tar.gz
Windows二进制	cosmo_1.18.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Mac OS X 10.9(小牛)
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/cosmo/tree/release - 2.8
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/cosmo/
包下载报告	下载数据