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这个包是2.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅魅力。

DNA甲基化魅力微阵列数据的分析

Bioconductor版本:2.8

这个方案实现了对DNA甲基化分析工具生成的数据使用罗氏微阵列和McrBC协议。它发现样本之间的差异甲基化区域,计算百分比甲基化估计,包括数组质量评估工具。

作者:彼得村上,哈里斯贾菲,马丁•阿尔耶前来Srinivasan Yegnasubramanian,拉斐尔•伊

维护人员:马丁·阿尔耶前来<阿尔耶前来jhu.edu >

安装

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PDF		charm.pdf
PDF		参考手册

细节

biocViews	生物信息学,DNAMethylation,微阵列,软件
版本	1.4.0
Bioconductor自	BioC 2.6 (r - 2.11)(6年)
许可证	LGPL (> = 2)
取决于	R (> = 2.11.0),Biobase,SQN,字段,RColorBrewer,genefilter
进口	BSgenome,Biobase,益生元(> = 1.11.31),oligoClasses(> = 1.9.42),ff,preprocessCore、方法、统计数据Biostrings,IRanges,siggenes,nor1mix,gtools、grDevices图形,跑龙套
链接
建议	charmData,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	charmData
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	charm_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	charm_1.4.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Mac OS X 10.9(小牛)
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/charm/tree/release - 2.8
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/charm/
包下载报告	下载数据