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这个包是2.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅arrayQualityMetrics。

质量标准在微阵列数据集

Bioconductor版本:2.8

这个包生成微阵列数据质量度量报告在Bioconductor微阵列数据容器(ExpressionSet, NChannelSet AffyBatch)。报告包含通用和特定于平台的部分。1和2的颜色阵列平台都支持。

作者:沃尔夫冈·胡贝尔奥黛丽•考夫曼

维修工:奥黛丽考夫曼<考夫曼在bergonie.org >

安装

安装这个包,开始R和输入:

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文档

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browseVignettes (“arrayQualityMetrics”)

PDF		aqm.pdf
PDF		arrayQualityMetrics.pdf
PDF		参考手册

细节

biocViews	微阵列,OneChannel,质量控制,ReportWriting,软件,TwoChannel
版本	3.8.0
Bioconductor自	BioC 2.1 (r - 2.6)(8.5年)
许可证	LGPL (> = 2)
取决于
进口	affy,affyPLM(> = 1.27.3),beadarray,Biobase,开罗(> = 1.4 6),genefilter、图形grDevices、网格Hmisc,hwriter,晶格,latticeExtra,limma、方法、RColorBrewer,setRNG,simpleaffy统计,SVGAnnotation(0.9 > = 0),跑龙套,vsn,XML
链接
建议	ALLMLL,亚兰
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	arrayQualityMetrics_3.8.0.tar.gz
Windows二进制	arrayQualityMetrics_3.8.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Mac OS X 10.9(小牛)
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/arrayqualitymetrics/tree/release - 2.8
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/arrayQualityMetrics/
包下载报告	下载数据