安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“SNPchip”)

在大多数情况下,您不需要下载包存档。

SNPchip

这个包是2.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅SNPchip

类和方法对高吞吐量SNP芯片数据

Bioconductor版本:2.8

这个包定义了策划类和函数拷贝数和高吞吐量的SNP基因型平台Affymetrix和Illumina公司等。特别是,SNPchip是一个有用的附加预处理后的可视化SNP-level益生元包估计。

作者:罗伯特Scharpf < rscharpf jhsph.edu >和Ingo Ruczinski

维护人员:罗伯特Scharpf < rscharpf jhsph.edu >

从内部引用(R,回车引用(“SNPchip”)):

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“SNPchip”)

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“SNPchip”)

PDF SNPchip.pdf
PDF 参考手册

细节

biocViews CopyNumberVariants,GeneticVariability,单核苷酸多态性,软件,可视化
版本 1.16.0
Bioconductor自 BioC 2.0 (r - 2.5)(9年)
许可证 LGPL (> = 2)
取决于 R (> = 2.10.0),Biobase(> =第2.7.4)、方法oligoClasses(> = 1.9.52),图形
进口 Biobase(> =第2.7.4)、图形grDevices,方法,oligoClasses(> = 1.9.52)统计,跑龙套
链接
建议 RSQLite,VanillaICE,RColorBrewer,genefilter,pd.mapping50k.xba240
SystemRequirements
增强了
URL http://www.biostat.jhsph.edu/ iruczins /软件/ snpchip.html
取决于我 mBPCR
进口我 crlmm,VanillaICE
建议我 类别
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源 SNPchip_1.16.0.tar.gz
Windows二进制 SNPchip_1.16.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Mac OS X 10.9(小牛)
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/bioconductor - mirror/snpchip/tree/release - 2.8
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/SNPchip/
包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心