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这个包是2.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅SNPchip。

类和方法对高吞吐量SNP芯片数据

Bioconductor版本:2.8

这个包定义了策划类和函数拷贝数和高吞吐量的SNP基因型平台Affymetrix和Illumina公司等。特别是,SNPchip是一个有用的附加预处理后的可视化SNP-level益生元包估计。

作者:罗伯特Scharpf < rscharpf jhsph.edu >和Ingo Ruczinski

维护人员:罗伯特Scharpf < rscharpf jhsph.edu >

安装

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文档

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PDF		SNPchip.pdf
PDF		参考手册

细节

biocViews	CopyNumberVariants,GeneticVariability,单核苷酸多态性,软件,可视化
版本	1.16.0
Bioconductor自	BioC 2.0 (r - 2.5)(9年)
许可证	LGPL (> = 2)
取决于	R (> = 2.10.0),Biobase(> =第2.7.4)、方法oligoClasses(> = 1.9.52),图形
进口	Biobase(> =第2.7.4)、图形grDevices,方法,oligoClasses(> = 1.9.52)统计,跑龙套
链接
建议	RSQLite,VanillaICE,RColorBrewer,genefilter,pd.mapping50k.xba240
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.biostat.jhsph.edu/ iruczins /软件/ snpchip.html
取决于我	mBPCR
进口我	crlmm,VanillaICE
建议我	类别
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	SNPchip_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	SNPchip_1.16.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Mac OS X 10.9(小牛)
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/snpchip/tree/release - 2.8
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/SNPchip/
包下载报告	下载数据