安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite(“林格”)

在大多数情况下,您不需要下载包存档。

林格

这个包是2.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅林格

R调查ChIP-chip Oligoarrays

Bioconductor版本:2.8

包林格推动ChIP-chip的主要分析数据。包装的主要功能是数据写入、质量评估、数据可视化和识别基因组区域显示ChIP-chip浓缩。包从罗氏函数处理双色寡核苷酸微阵列用于ChIP-chip项目,但也包含了更一般的函数ChIP-chip数据分析,考虑到数据提供RGList(生)或ExpressionSet(前处理)。的包使用函数从各种其他包Bioconductor项目和提供了额外的ChIP-chip-specific和NimbleGen-specific功能。

作者:Joern Toedling,奥列格•Sklyar Tammo克鲁格,沃尔夫冈·胡贝尔马特•里奇

维护人员:j . Toedling < joern。在curie.fr toedling >

从内部引用(R,回车引用(“林格”)):

安装

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文档

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PDF Ringo.pdf
PDF 参考手册

细节

biocViews DataImport,微阵列,预处理,质量控制,软件,TwoChannel
版本 1.16.0
Bioconductor自 BioC 2.0 (r - 2.5)(9年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 方法,Biobase(> = 1.14.1),RColorBrewer,limma,矩阵、网格
进口 genefilter,limma,vsn
链接
建议 rtracklayer(> = 1.3.1),mclust,topGO(> = 1.15.0)
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我 ccTutorial,斯塔尔
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源 Ringo_1.16.0.tar.gz
Windows二进制 Ringo_1.16.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Mac OS X 10.9(小牛)
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/bioconductor - mirror/ringo/tree/release - 2.8
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/Ringo/
包下载报告 下载数据

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Bioconductor

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支持»

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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心