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这个包是2.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅MEDIPS。

MeDIP-Seq数据分析

Bioconductor版本:2.8

MEDIPS开发分析数据来源于甲基化DNA免疫沉淀反应(MeDIP)实验测序(MeDIP-Seq)紧随其后。然而,功能和质量控制可能适用于其他类型的测序数据(例如ChIP-Seq)。MEDIPS地址MeDIP-Seq上下文中的数据分析几个方面。

作者:卢卡斯查韦斯Joern迪特里希

维护人员:卢卡斯查韦斯<查韦斯在molgen.mpg.de >

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PDF		MEDIPS.pdf
PDF		参考手册

细节

biocViews	ChIPseq,CpGIsland,DNAMethylation,DifferentialExpression,HighThroughputSequencing,预处理,质量控制,测序,软件,可视化
版本	1.2.0
Bioconductor自	BioC 2.7 (r - 2.12)(5.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 2.12.0),BSgenome
进口	Biostrings,BSgenome、图形、gtools,IRanges、方法、统计跑龙套
链接
建议	BSgenome,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19
SystemRequirements
增强了
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取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	MEDIPS_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	MEDIPS_1.2.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Mac OS X 10.9(小牛)
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/medips/tree/release - 2.8
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MEDIPS/
包下载报告	下载数据