安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“GeneRegionScan”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
这个包是2.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅GeneRegionScan。
Bioconductor版本:2.8
一个包与重点分析的离散区域的基因组。这个包是用于一个或几个基因的调查使用Affymetrix数据,因为它将使用Affymetrix电动工具提取探测器级数据应用和包装ProbeLevelSet这些数据。expressionSet ProbeLevelSet直接扩展,但包括额外的信息每个探针和探针的序列来自。包包含许多功能用于绘制这些探测水平数据沿着mRNA-strands序列位置的函数。可变剪接,这可以用于分析,尤其适合使用exon-array数据。
作者:Lasse Folkersen,迭戈Diez
维护人员:Lasse Folkersen < Lasse。在ki.se folkersen >
从内部引用(R,回车引用(“GeneRegionScan”)
):
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“GeneRegionScan”)
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“GeneRegionScan”)
GeneRegionScan.pdf | ||
参考手册 |
biocViews | DataImport,微阵列,OneChannel,单核苷酸多态性,软件,可视化 |
版本 | 1.8.0 |
Bioconductor自 | BioC 2.4 (r - 2.9)(7年) |
许可证 | GPL (> = 2) |
取决于 | 方法,Biobase(> = 2.5.5),Biostrings |
进口 | Biobase(> = 2.5.5),affxparser,RColorBrewer,Biostrings |
链接 | |
建议 | BSgenome,affy,AnnotationDbi |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
包的来源 | GeneRegionScan_1.8.0.tar.gz |
Windows二进制 | GeneRegionScan_1.8.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | |
Mac OS X 10.9(小牛) | |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/generegionscan/tree/release - 2.8 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/GeneRegionScan/ |
包下载报告 | 下载数据 |