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这个包是2.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅GSVA。

组基因变异分析

Bioconductor版本:2.8

基因变异分析(GSVA)是一种非参数,无监督方法估计变异的基因集富集的样品表达数据集。GSVA执行改变坐标系统,将数据从一个基因样本矩阵的基因片段的样本矩阵,从而使评价途径为每个样品浓缩。这个新矩阵GSVA浓缩成绩促进应用标准分析方法如功能性浓缩、生存分析、集群、CNV-pathway分析或cross-tissue通路分析,pathway-centric的方式。在所有平台上用户必须安装GNU科学图书馆;见README文件,这个文件的源分布,获取详细信息。

作者:贾斯汀Guinney <贾斯汀。在sagebase.org guinney >(with contributions from Robert Castelo and Sonja Haenzelmann

维护人员:贾斯汀Guinney <贾斯汀。在sagebase.org guinney >

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PDF		GSVA.pdf
PDF		参考手册

细节

biocViews	生物信息学,微阵列,通路,软件
版本	1.0.1
Bioconductor自	BioC 2.8 (r - 2.13)(5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R(> = 2.13.0)方法
进口	方法,Biobase,GSEABase
链接
建议	limma,qpgraph,图,Rgraphviz,RColorBrewer,genefilter,GSVAdata
SystemRequirements	GNU科学图书馆> = 1.12
增强了	雪,多核
URL	http://www.sagebase.org
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	GSVA_1.0.1.tar.gz
Windows二进制	GSVA_1.0.1.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Mac OS X 10.9(小牛)
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/gsva/tree/release - 2.8
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/GSVA/
包下载报告	下载数据