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# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“GOSemSim”)

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GOSemSim

这个包是2.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅GOSemSim

GO-terms语义相似性度量

Bioconductor版本:2.8

蕾斯尼克提出的五个方法实现,Schlicker江,林和王分别估算语义相似之处。支持许多物种,包括按蚊,拟南芥,牛,狗,鸡,黑猩猩,Coelicolor,大肠杆菌菌株K12的酒井法子,飞翔,人类,疟疾,鼠,猪,猴,鼠,蠕虫,非洲爪蟾蜍,酵母,斑马鱼。

作者:Guangchuang余

维护人员:Guangchuang于< guangchuangyu gmail.com >

从内部引用(R,回车引用(“GOSemSim”)):

安装

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# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“GOSemSim”)

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PDF 参考手册

细节

biocViews Anopheles_gambiae,Arabidopsis_thaliana,Bos_taurus,Caenorhabditis_elegans,Canis_familiaris,聚类,Danio_rerio,Drosophila_melanogaster,Escherichia_coli,,Gallus_gallus,Homo_sapiens,Mus_musculus,Pan_troglodytes,通路,Plasmodium_falciparum,Rattus_norvegicus,Saccharomyces_cerevisiae,软件,Streptomyces_coelicolor,Sus_scrofa,Xenopus_laevis
版本 1.10.2
Bioconductor自 BioC 2.4 (r - 2.9)(7年)
许可证 GPL-2
取决于
进口 方法,AnnotationDbi,GO.db,org.Hs.eg.db,org.Ag.eg.db,org.At.tair.db,org.Bt.eg.db,org.Ce.eg.db,org.Cf.eg.db,org.Dm.eg.db,org.Dr.eg.db,org.EcK12.eg.db,org.EcSakai.eg.db,org.Gg.eg.db,org.Mm.eg.db,org.Mmu.eg.db,org.Pf.plasmo.db,org.Pt.eg.db,org.Rn.eg.db,org.Sc.sgd.db,org.Sco.eg.db,org.Ss.eg.db,org.Xl.eg.db
链接
建议 clusterProfiler
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我 clusterProfiler
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源 GOSemSim_1.10.2.tar.gz
Windows二进制 GOSemSim_1.10.2.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Mac OS X 10.9(小牛)
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/bioconductor - mirror/gosemsim/tree/release - 2.8
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/GOSemSim/
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