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这个包是2.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅GGtools。

软件和数据的遗传基因表达(c) 2006 VJ凯莉

Bioconductor版本:2.8

人类基因组单体型图SNP处理报告,GWAS等等。

作者:文斯凯里< stvjc channing.harvard.edu >

维修工:文斯凯里< stvjc channing.harvard.edu >

安装

安装这个包,开始R和输入:

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文档

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PDF		binf09supp.pdf
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PDF		GGtools_2011.pdf
PDF		lab2010.pdf
PDF		参考手册

细节

biocViews	生物信息学,GeneticVariability,遗传学,单核苷酸多态性,软件
版本	3.10.2
Bioconductor自	BioC 1.9 (r - 2.4)(9.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(> = 2.7.0)、方法Biobase(> = 1.11.26),GGBase(> = 3.7.5),snpStats(> = 1.1.10),注释,IRanges,rtracklayer,org.Hs.eg.db,GenomicRanges(> = 1.3.38),ff
进口	AnnotationDbi,IRanges(> = 1.1.6),annaffy,GSEABase,rtracklayer
链接
建议	illuminaHumanv1.db,org.Hs.eg.db,SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20100427,rpart,rtracklayer,GSEABase,ceu1kg,ceuhm3,SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20090506,genefilter,hmyriB36
SystemRequirements
增强了	多核,Rsamtools
URL
取决于我	ceu1kg,cheung2010,encoDnaseI
进口我	ceuhm3
建议我	hmyriB36,ind1KG
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	GGtools_3.10.2.tar.gz
Windows二进制	GGtools_3.10.2.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Mac OS X 10.9(小牛)
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/ggtools/tree/release - 2.8
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/GGtools/
包下载报告	下载数据