安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“GGBase”)

在大多数情况下,您不需要下载包存档。

GGBase

这个包是2.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅GGBase

基础设施的遗传学基因表达(c) 2008 VJ凯莉

Bioconductor版本:2.8

基础设施来处理人类基因组单体型图SNP报道,GWAS等等。

作者:文斯凯里< stvjc channing.harvard.edu >

维修工:文斯凯里< stvjc channing.harvard.edu >

从内部引用(R,回车引用(“GGBase”)):

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“GGBase”)

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“GGBase”)

PDF GGBase.pdf
PDF makeSMLset.pdf
PDF newSNPloc.pdf
PDF 参考手册

细节

biocViews 生物信息学,GeneticVariability,遗传学,单核苷酸多态性,软件
版本 3.12.0
Bioconductor自 BioC 2.2 (r - 2.7)(8年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R(> = 2.7.0)、方法Biobase(> = 2.9.0),snpStats(> = 1.1.10),RSQLite
进口 AnnotationDbi
链接
建议 illuminaHumanv1.db,SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20090506
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我 ceu1kg,ceuhm3,encoDnaseI,GGdata,GGtools,hmyriB36
进口我
建议我 ind1KG
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源 GGBase_3.12.0.tar.gz
Windows二进制 GGBase_3.12.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Mac OS X 10.9(小牛)
Subversion源 (用户名/密码:只读的)
Git源代码 https://github.com/bioconductor - mirror/ggbase/tree/release - 2.8
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/GGBase/
包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请阅读发布指南。文章质疑Bioconductor到以下位置:

  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网
弗雷德哈钦森癌症研究中心