安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“GGBase”)
在大多数情况下,您不需要下载包存档。
这个包是2.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅GGBase。
Bioconductor版本:2.8
基础设施来处理人类基因组单体型图SNP报道,GWAS等等。
作者:文斯凯里< stvjc channing.harvard.edu >
维修工:文斯凯里< stvjc channing.harvard.edu >
从内部引用(R,回车引用(“GGBase”)
):
安装这个包,开始R和输入:
# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“GGBase”)
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“GGBase”)
GGBase.pdf | ||
makeSMLset.pdf | ||
newSNPloc.pdf | ||
参考手册 |
biocViews | 生物信息学,GeneticVariability,遗传学,单核苷酸多态性,软件 |
版本 | 3.12.0 |
Bioconductor自 | BioC 2.2 (r - 2.7)(8年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R(> = 2.7.0)、方法Biobase(> = 2.9.0),snpStats(> = 1.1.10),RSQLite |
进口 | AnnotationDbi |
链接 | |
建议 | illuminaHumanv1.db,SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20090506 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | ceu1kg,ceuhm3,encoDnaseI,GGdata,GGtools,hmyriB36 |
进口我 | |
建议我 | ind1KG |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
包的来源 | GGBase_3.12.0.tar.gz |
Windows二进制 | GGBase_3.12.0.zip |
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard) | |
Mac OS X 10.9(小牛) | |
Subversion源 | (用户名/密码:只读的) |
Git源代码 | https://github.com/bioconductor - mirror/ggbase/tree/release - 2.8 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/GGBase/ |
包下载报告 | 下载数据 |