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这个包是2.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅生命网络。

例程,生物网络的功能分析

Bioconductor版本:2.8

这个包提供了功能集成的分析蛋白质相互作用网络和功能模块的检测。不同的数据集可以被集成到网络分配假定值的统计测试网络的节点。例如假定值从微分表达式获得的基因从一个Affymetrix数组分配给网络的节点。通过拟合beta-uniform混合模型假定值和计算分数,总分的网络可以计算区域和一个整数线性规划算法确定最大得分子网。

作者:马库斯>,达妮埃拉Beisser

维护人员:马库斯> <马库斯。在biozentrum.uni-wuerzburg.de > >

安装

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文档

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browseVignettes(“生命网络”)

PDF		bum1.pdf
PDF		bum2.pdf
PDF		cytoscape.pdf
PDF		prec_recall_large.pdf
PDF		prec_recall_small.pdf
PDF		Tutorial-3dplot.pdf
PDF		包
PDF		参考手册

细节

biocViews	生物信息学,DataImport,DifferentialExpression,GeneExpression,GraphsAndNetworks,微阵列,软件,可视化
版本	1.10.1
Bioconductor自	BioC 2.7 (r - 2.12)(5.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 2.10.0),Biobase,图,RBGL
进口	igraph,AnnotationDbi
链接
建议	rgl,嫁祸于,DLBCL,genefilter,xtable,所有,limma,hgu95av2.db,XML
SystemRequirements
增强了
URL	http://bionet.bioapps.biozentrum.uni-wuerzburg.de/
取决于我	HTSanalyzeR
进口我	HTSanalyzeR
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	BioNet_1.10.1.tar.gz
Windows二进制	BioNet_1.10.1.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Mac OS X 10.9(小牛)
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/bionet/tree/release - 2.8
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/BioNet/
包下载报告	下载数据