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这个包是2.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅ArrayTools。

geneChip分析包

Bioconductor版本:2.8

这个包质量评估旨在提供解决方案和差异表达基因检测Affymetrix GeneChips,包括1.0 - 3 '借助于和基因阵列。HTML格式的包生成综合分析报告。报告页面上的超链接会导致一系列的QC情节,处理数据,差异表达基因列表。报告表格格式的差异表达基因注释超链接在线生物数据库。

作者:Xiwei吴,阿瑟·李

维修工:亚瑟·李在coh.org < xueli >

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PDF		ArrayTools.pdf
PDF		参考手册

细节

biocViews	注释,DifferentialExpression,微阵列,OneChannel,预处理,质量控制,ReportWriting,软件,统计数据,可视化
版本	1.12.0
Bioconductor自	BioC 2.3 (r - 2.8)(7.5年)
许可证	LGPL (> = 2.0)
取决于	R (> = 2.7.0),affy(> = 1.23.4),Biobase(> = 2.5.5)方法
进口	affy,Biobase、图形、grDeviceslimma、方法、统计跑龙套,xtable
链接
建议	simpleaffy,R2HTML,affydata,affyPLM,genefilter,annaffy,gcrma,hugene10sttranscriptcluster.db
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	ArrayTools_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	ArrayTools_1.12.0.zip
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Mac OS X 10.9(小牛)
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/arraytools/tree/release - 2.8
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ArrayTools/
包下载报告	下载数据