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这个包是2.8版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅ArrayExpressHTS。

ArrayExpress高通量测序处理管道

Bioconductor版本:2.8

公共ArrayExpress RNA-Seq处理管道实验或本地数据集

作者:安琪拉Goncalves,安德鲁Tikhonov

维护人员:安吉拉Goncalves < filimon ebi.ac。英国>,安德鲁Tikhonov <安德鲁在ebi.ac.uk >

安装

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PDF		ArrayExpressHTS.pdf
PDF		参考手册

细节

biocViews	HighThroughputSequencing,RNAseq,测序,软件
版本	1.2.0
Bioconductor自	BioC 2.8 (r - 2.13)(5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	抽样,Rsamtools(> = 1.3.32),雪
进口	Biobase,Biostrings,DESeq,GenomicRanges,Hmisc,IRanges,R2HTML,RColorBrewer,Rsamtools,ShortRead,XML,biomaRt,刨边机、grDevices、图形、方法rJava统计数据,svMisc,跑龙套
链接	Rsamtools
建议
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包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

包的来源	ArrayExpressHTS_1.2.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.6 (Snow Leopard)
Mac OS X 10.9(小牛)
Subversion源	(用户名/密码:只读的)
Git源代码	https://github.com/bioconductor - mirror/arrayexpresshts/tree/release - 2.8
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ArrayExpressHTS/
包下载报告	下载数据