VSN.

微阵列数据的方差稳定和校准

Biocometiond版本：2.7

该包实现了一种用于归一化微阵列强度的方法，两者在阵列内的颜色和数组之间。该方法使用用于参考文献中描述的微阵列数据的随机模型的最大似然估计器的鲁棒型（见Vignette）。该模型包含数据校准（A.K.A.归一化），是依赖于平均强度方差的模型，以及稳定数据变换的方差。转换强度之间的差异类似于“归一化对数比率”。然而，与后者相比，它们的差异与平均值无关，并且它们通常更敏感，并且在检测差分转录方面是更敏感的。

作者：Wolfgang Huber，来自Anja Von Heydebereck的贡献。用户的许多评论和建议被承认，其中包括Dennis Kostka，David Kreil，Hans-Ulrich Klein，Robert绅士，Deepayan Sarkar和Gordon Smyth。

维护者：Wolfgang Huber

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源（“http://biocondudard.org/bioclite.r”）Bioclite（“VSN”）

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引文（“vsn”）

文件

PDF.	r script.	VSN介绍
PDF.	r script.	VSN的可能性计算
PDF.	r script.	使用模拟数据验证和评估性能
PDF.		参考手册

细节

Biocviews.	微阵列那oneChannel.那两种通道那预处理
依靠	BioBase.（> = 2.5.5）
进口	方法，敬服（> = 1.23.4），林马那格子
建议	yefydata.那hgu95av2cdf.
系统要求
执照	艺术-2.0
URL.	http://www.r-project.org，http://www.ebi.ac.uk/huber.
取决于我	怀特拉拉那ArrayqualityMetrics.那cellhts2.那lvsmirna.那webbioc.
进口我	ImageHts.那林诺那t
建议我	adsplit.那AGI4X44Prepess.那Beadarray.那Bioccasestudies.那细胞那雌激素那Globalancova那全球化境那林马那lumi.那暮
版本	3.18.0
自从	Biocumon 1.6（R-2.1）或更早

包装下载

包来源	vsn_3.18.0.tar.gz.
Windows二进制文件	vsn_3.18.0.zip.（32-＆64位）
MacOS 10.5（豹）二进制	vsn_3.18.0.tgz.
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