eisa

通过迭代签名算法表达数据分析

Bioconductor版本:2.7

迭代签名算法(ISA)是一个biclustering方法;找到相关的块(转录模块)基因表达的数据(或其他表格)。ISA能够找到重叠模块和噪音是有弹性的。这个包提供了一个方便的ISA接口,使用标准BioConductor数据结构;也包含各种可视化工具,可以用于其他biclustering算法。

作者:伽柏Csardi <伽柏。在unil.ch Csardi >

维护人员:伽柏Csardi <伽柏。在unil.ch Csardi >

安装这个包,开始R和输入:

源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (eisa)

在出版物引用这个包,开始R和输入:

引用(eisa)

文档

PDF	R脚本	eisa和biclust包
PDF	R脚本	基因表达数据的迭代签名算法
PDF		参考手册

细节

biocViews	分类,可视化,微阵列,GeneExpression
取决于	方法,isa2,Biobase,AnnotationDbi,类别,genefilter,DBI
进口
建议	igraph(> = 0.5.2),矩阵,GOstats,GO.db,KEGG.db,biclust,质量,xtable,所有,hgu95av2.db
系统需求
许可证	GPL (> = 2)
URL
取决于我
进口我	ExpressionView
建议我
版本	1.2.0
自	Bioconductor 2.6 (r - 2.11)

包下载

包的来源	eisa_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	eisa_1.2.0.zip(32位和64位)
MacOS 10.5(豹)二进制	eisa_1.2.0.tgz
包下载报告	下载数据