魅力

CHARM微阵列DNA甲基化数据分析

Bioconductor版本:2.7

该软件包实现了使用Nimblegen微阵列和McrBC协议生成的DNA甲基化数据的分析工具。它可以在样品之间找到不同的甲基化区域，计算甲基化估计的百分比，并包括阵列质量评估工具。

作者:Martin Aryee, Peter Murakami, Harris Jaffee, Srinivasan Yegnasubramanian, Rafael Irizarry

维护者:Martin Aryee < Aryee at jhu.edu>

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源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“魅力”)

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引用(“魅力”)

文档

PDF	R脚本	魅力装饰图案
PDF		参考手册

细节

biocViews	微阵列，生物信息学，DNAMethylation
取决于	R (>= 2.11.0)，Biobase，SQN，字段，RColorBrewer，genefilter
进口	BSgenome，Biobase，益生元(>= 1.11.31)， oligoClasses(>= 1.9.42)ff，preprocessCore，方法，统计，Biostrings，IRanges，siggenes，nor1mix，gtools， grDevices，图形，utils
建议	charmData，BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18
系统需求
许可证	LGPL (>= 2)
URL
全靠我	charmData
进口我
建议我
版本	1.2.1 "
自	Bioconductor 2.6 (R-2.11)

包下载

包的来源	charm_1.2.1.tar.gz
Windows二进制	charm_1.2.1.zip(32位和64位)
MacOS 10.5 (Leopard)二进制文件	charm_1.2.1.tgz
软件包下载报告	下载数据