beadarray

质量评估和低级Illumina公司BeadArray数据分析

Bioconductor版本:2.7

包能够读取bead-level数据(生口角和文本文件)输出BeadScan以及从BeadStudio bead-summary数据。质量评估方法和低层次的分析。

作者:马克·邓宁迈克史密斯,乔纳森•凯恩斯安迪•林奇马特里奇

维护人员:马克邓宁<马克。邓宁在cancer.org.uk >

安装这个包,开始R和输入:

源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“beadarray”)

在出版物引用这个包,开始R和输入:

引用(“beadarray”)

文档

PDF	R脚本	beadarray.pdf
PDF	R脚本	beadlevel.pdf
PDF		beadsummary.pdf
PDF		参考手册

细节

biocViews	微阵列,OneChannel,质量控制,预处理
取决于	Biobase(> = 2.5.5)方法
进口	BeadDataPackR,limma
建议	光民,vsn,affy,hwriter
系统需求
许可证	GPL-2
URL
取决于我
进口我	arrayQualityMetrics
建议我	beadarraySNP,光民
版本	2.0.6
自	Bioconductor 1.8 (r - 2.3)

包下载

包的来源	beadarray_2.0.6.tar.gz
Windows二进制	beadarray_2.0.6.zip(32位和64位)
MacOS 10.5(豹)二进制	beadarray_2.0.6.tgz
包下载报告	下载数据