副词

Affymetrix寡核苷酸阵列的方法

生物导体版本:2.7

该软件包包含用于探索性寡核苷酸阵列分析的功能。对tkwidgets的依赖性仅涉及几乎没有便利功能。没有它,“ affy”是完全功能的。

作者:Rafael A. Irizarry ,laurent Gautier ,Benjamin Milo Bolstad with with picr.man.ac.uk> with with withMagnus Astrand ,Leslie M. Cope ,Robert Gentleman,Jeff Gentry,Jeff Gentry,Conrad Halling,Conrad Halling ,wolfggang Huber,James Macdonald ,Benjamin I. P. Rubinstein,Christopher Workman ,John Zhang

维护者:Rafael A. Irizarry

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来源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ affy”)

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引用(“ affy”)

文档

PDF R脚本 1.底漆
PDF R脚本 2.内置处理方法
PDF R脚本 3.自定义处理方法
PDF R脚本 4.导入方法
PDF 参考手册

细节

生物浏览 微阵列,,,,Onechannel,,,,预处理
要看 r(> = 2.8.0),生物酶(> = 2.5.5)
进口 affyio(> = 1.13.3),生物酶(> = 2.5.5),图形,grdevices,方法,预处理,统计,utils
建议 tkwidgets(> = 1.19.0),Affydata
系统要求
执照 LGPL(> = 2.0)
URL
取决于我 Affycontam,,,,Affycoretools,,,,Affydata,,,,AffyExpress,,,,affylmgui,,,,艾爱,,,,affypdnn,,,,affyplm,,,,Affyqcreport,,,,agimicrorna,,,,allmll,,,,altcdfenvs,,,,ampaffyexample,,,,arraymvout,,,,Arraytools,,,,BGX,,,,Bronchialil13,,,,Cll,,,,双重,,,,生态酮,,,,雌激素,,,,外部图,,,,农场,,,,GCRMA,,,,lmgene,,,,logitt,,,,lvsmirna,,,,MADB,,,,maqcsubset,,,,maqcsubsetafx,,,,mvoutdata,,,,,,,,plw,,,,彪马,,,,Pumadata,,,,qpcrnorm,,,,refplus,,,,RHVDM,,,,RPA,,,,简单,,,,斯派金,,,,SpikeInsubset,,,,SScore,,,,斯塔尔,,,,Webbioc,,,,XHYBCASNEUF
进口我 Affyilm,,,,Affyqcreport,,,,Affyling,,,,ArrayExpress,,,,ArrayQualityMetrics,,,,Arraytools,,,,农场,,,,FRMA,,,,Frmatools,,,,GCRMA,,,,GeoSubsiend,,,,刺激性,,,,htqpcr,,,,Lumi,,,,makecdfenv,,,,钳子,,,,plw,,,,彪马,,,,简单,,,,蒂格拉里,,,,VSN
建议我 AnnotationDbi,,,,Beadarray,,,,Beadarraysnp,,,,生物探测,,,,生物弦,,,,BufferedMatrixMethods,,,,雌激素,,,,ExpressionView,,,,事实设计,,,,Generegionscan,,,,Hexbin,,,,林玛,,,,制造4,,,,Onechannelgui,,,,siggenes
版本 1.28.1
自从 生物导体1.6(R-2.1)或更早

软件包下载

包源 affy_1.28.1.tar.gz
Windows二进制 affy_1.28.1.zip(32-和64位)
MacOS 10.5(豹)二进制 affy_1.28.0.tgz
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常见的生物导体工作流程包括:

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