GOstats

去微阵列的操作工具。

Bioconductor版本:2.7

相互作用的一组工具和微阵列数据。各种基本操作工具图,假设检验和其他简单的计算。

作者:r .绅士和猎鹰

维护人员:Biocore团队c / o BioC用户列表< bioconductor在stat.math.ethz.ch >

安装这个包,开始R和输入:

源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“GOstats”)

在出版物引用这个包,开始R和输入:

引用(“GOstats”)

文档

PDF		超几何测试不太常见的生物模型
PDF	R脚本	使用GOstats超几何测试
PDF	R脚本	使用GOstats可视化数据
PDF		参考手册

细节

biocViews	生物信息学,注释,去,MultipleComparisons
取决于	Biobase(> = 1.15.29),类别(> = 2.3.26),图
进口	AnnotationDbi(> = 0.0.89),Biobase(> = 1.15.29),类别(> = 2.3.26),GO.db(> = 1.13.0),RBGL,注释(> = 1.13.2),图(> = 1.15.15)、方法、统计数据
建议	hgu95av2.db(> = 1.13.0),所有,GO.db(> = 1.13.0),注释,乘,genefilter,RColorBrewer,Rgraphviz,xtable,SparseM
系统需求
许可证	艺术- 2.0
URL
取决于我	吸引,oneChannelGUI
进口我	affycoretools,吸引
建议我	BiocCaseStudies,eisa,GSEAlm,HTSanalyzeR,qpgraph,安全
版本	2.16.0
自	Bioconductor 1.6 (r - 2.1)或更早

包下载

包的来源	GOstats_2.16.0.tar.gz
Windows二进制	GOstats_2.16.0.zip(32位和64位)
MacOS 10.5(豹)二进制	GOstats_2.16.0.tgz
包下载报告	下载数据