ArrayTools

基因芯片分析包

Bioconductor版本:2.7

该软件包旨在为Affymetrix GeneChips提供质量评估和检测差异表达基因的解决方案，包括3' -阵列和基因1.0-ST阵列。该软件包生成HTML格式的综合分析报告。报告页面上的超链接将指向一系列QC图、处理过的数据和差异表达基因列表。差异表达基因报告在表格格式与注释超链接到在线生物数据库。

作者:吴锡伟，Arthur Li

维护者:Arthur Li

要安装这个包，启动R并输入:

源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“ArrayTools”)

要在出版物中引用此包，请输入R并输入:

引用(“ArrayTools”)

文档

PDF	R脚本	1.底漆
PDF		参考手册

细节

biocViews	微阵列，OneChannel，质量控制，预处理，统计数据，DifferentialExpression，注释，ReportWriting，可视化
取决于	R (>= 2.7.0)，affy(> = 1.23.4),Biobase(>= 2.5.5)，方法
进口	affy，Biobase，图形，grDevices，limma，方法，统计，utils，xtable
建议	simpleaffy，R2HTML，affydata，affyPLM，genefilter，annaffy，gcrma，hugene10sttranscriptcluster.db
系统需求
许可证	LGPL (>= 2.0)
URL
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版本	1.10.0
自	Bioconductor 2.3 (R-2.8)

包下载

包的来源	ArrayTools_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	ArrayTools_1.10.0.zip(32位和64位)
MacOS 10.5 (Leopard)二进制文件	ArrayTools_1.10.0.tgz
软件包下载报告	下载数据