ArrayExpress

访问ArrayExpress微阵列数据库在EBI和构建Bioconductor数据结构:ExpressionSet, AffyBatch NChannelSet

Bioconductor版本:2.7

访问在EBI和构建Bioconductor ArrayExpress库数据结构:ExpressionSet, AffyBatch NChannelSet

作者:奥黛丽考夫曼

维护人员:奥黛丽考夫曼< akauffmann。在gmail.com bioinfo >

安装这个包,开始R和输入:

源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“ArrayExpress”)

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引用(“ArrayExpress”)

文档

PDF	R脚本	ArrayExpress:导入和R ArrayExpress数据集转换成对象
PDF		参考手册

细节

biocViews	微阵列,DataImport,OneChannel,TwoChannel
取决于	R (> = 2.9.0),Biobase(> =测试盒框)
进口	XML,affy,limma
建议	arrayQualityMetrics
系统需求
许可证	艺术- 2.0
URL
取决于我
进口我
建议我
版本	1.10.0
自	Bioconductor 2.3 (r - 2.8)

包下载

包的来源	ArrayExpress_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	ArrayExpress_1.10.0.zip(32位和64位)
MacOS 10.5(豹)二进制	ArrayExpress_1.10.0.tgz
包下载报告	下载数据