################################################### ### 块数量1:准备 ################################################### 图书馆(“cellHTS ") ################################################### ### 块2号:readPlateData ################################################### experimentName = " ApoptosisScreen " dataPath公司=系统。文件(“extdata”,包=“普拉达”)x = readPlateData(“Platelist.txt”,名称= experimentName路径= dataPath公司verbose = FALSE) x ################################################### ### 块数量3:配置 ################################################### confFile =文件。path(dataPath， "Plateconf.txt") logFile =文件。path(dataPath， "Screenlog.txt") description file =文件。路径(dataPath公司,“Description.txt”)x =配置(x, confFile,日志文件,descripFile ) ################################################### ### 块数量4:正常化 ################################################### x美元xnorm < - log10 (x xraw美元)x美元状态(“规范化”)< -真的 ################################################### ### 块5号:报告eval = FALSE ################################################### ## geneIDFile =文件。path(dataPath， " geneid .txt") ## x = annotate(x, geneIDFile) ## writeReport(x, force = TRUE, plotPlateArgs = list(xrange =c(0.2， ## 1.5)， xcol=c("white"， "red")))， ## imageScreenArgs = list(zrange =c(-2, 6.5)， ar = 1)))