################################################### ### 块1号 : ################################################### 选项(宽度= 60 ) ################################################### ### 块2号:参数 ################################################### 库(XDE)数据(expressionSetList) xlist < - expressionSetList params < -新(“XdeParameter esetList = xlist phenotypeLabel =“adenoVsquamous”)参数 ################################################### ### 块3号:firstMcmc ################################################### initialvalue < - firstMcmc str (initialvalue (params) ) ################################################### ### 块数量4:specifiedInitialValues ################################################### params@specifiedInitialValues ################################################### ### 块5号:hyperparameters ################################################### hyperparameters (params ) ################################################### ### 块6号:hyperparamReplace eval = FALSE ################################################### ## hyperparameters (params)(“α。一个“]< - 1 ################################################### ### 块数量7:调优 ################################################### 调优(params ) ################################################### ### 块8号:changeEpsilon ################################################### 调优(params) [a] < -调优(params) [a] * 0.5 ################################################### ### 块数量9:更新 ################################################### 更新(params ) ################################################### ### 块10号:共轭性eval = FALSE ################################################### ## firstMcmc (params) $ B < -代表(1、3)# #更新(params) [B] < - 0 ################################################### ### 块11号:独立eval = FALSE ################################################### ## firstMcmc (params) $ B < -代表(0,3)# #更新(params) [B] < - 0 ################################################### ### 块12号:blockUpdates eval = FALSE ################################################### ## 更新(params)(“rAndC2”)< - 3所示 ################################################### ### 块13号:输出 ################################################### 输出(params ) ################################################### ### 块14号:differentPath eval = FALSE ################################################### ## 目录(params) <——“日志 " ################################################### ### 块数量15:燃烧 ################################################### 燃烧(params) < -真正的迭代(params) < - 5 ################################################### ### 块16号:burnin2 ################################################### 输出(params)[22] < -代表(21)输出(params)燃烧(params) < -真正的输出(参数 ) ################################################### ### 块数量17:burnin3 ################################################### ## 指定一个瘦1并保存所有的参数输出(params)[22] < -代表(0,21)输出(params)燃烧(params) < -错误的输出(参数 ) ################################################### ### 块18号:doNotSaveHugeChains ################################################### 燃烧(params) < -错误的输出(params) [c(“怒”、“DDelta”,“三角洲”,“probDelta”、“sigma2”、“φ”)]< - 0输出(参数 ) ################################################### ### 19块数量 : ################################################### toLatex (sessionInfo ())